RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	FIN1	Q03898	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NHX1	Q04121	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	AIM32	Q04689	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TPK2	P06245	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ABF1	P14164	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ESS1	P22696	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MNE1	P24720	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ECM4	P36156	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CDC1	P40986	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FIG4	P42837	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SNZ3	P43545	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SNZ2	P53824	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CDC55	Q00362	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MRX10	Q05648	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PNP1	Q05788	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SIN4	P32259	974 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PEP12	P32854	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	AVT2	P39981	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SWM2	P40342	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ROM1	P53046	1155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CWC24	P53769	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ORC3	P54790	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BCH1	Q05029	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PUS5	Q06244	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NSL1	Q12143	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RMD5	Q12508	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RGS2	Q99188	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RIM15	P43565	1770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PHO13	P19881	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	POL4	P25615	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NUP2	P32499	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BET3	P36149	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YMC2	P38087	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YGR153W	P48238	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YML119W	Q03208	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PLP1	Q04004	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PBS2	P08018	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	LYP1	P32487	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SKN1	P33336	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	IAH1	P41734	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MAF1	P41910	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SET4	P42948	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CLB2	P24869	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RNP1	P32385	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ERP5	P38819	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SDP1	P40479	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ELP2	P42935	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YJL055W	P47044	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GTR2	P53290	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FAR8	Q05040	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NRT1	Q08485	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MSW1	P04803	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPO11	P23179	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TDP1	P38319	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MSG5	P38590	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ERC1	P38767	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CCC2	P38995	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	STP1	Q00947	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ACS1	Q01574	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPP1	Q03012	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FET3	P38993	636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	APS3	P47064	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BIR1	P47134	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SHE9	Q04172	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YKR015C	P36111	568 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SEO1	P39709	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BIT61	P47041	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CAF120	P53836	1060 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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