Protein–RNA interactions for Protein: Q12143

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1, yeastyeast

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSL1Q12143 NSR1YGR159C 1245 nt19.66■□□□□ 0.74
NSL1Q12143 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.47■□□□□ 0.71
NSL1Q12143 NOP1YDL014W 984 nt18.79■□□□□ 0.6
NSL1Q12143 MDJ1YFL016C 1536 nt17.81■□□□□ 0.44
NSL1Q12143 YKL036CYKL036C 393 nt16.94■□□□□ 0.3
NSL1Q12143 YJL027CYJL027C 417 nt16.44■□□□□ 0.22
NSL1Q12143 SRX1YKL086W 384 nt16.37■□□□□ 0.21
NSL1Q12143 Q0297Q0297 156 nt16.27■□□□□ 0.2
NSL1Q12143 DBP2YNL112W 1641 nt15.55■□□□□ 0.08
NSL1Q12143 YCR051WYCR051W 669 nt15.53■□□□□ 0.08
NSL1Q12143 YBR190WYBR190W 312 nt15.3■□□□□ 0.04
NSL1Q12143 SCS3YGL126W 1143 nt15.19■□□□□ 0.02
NSL1Q12143 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.02■□□□□ -0
NSL1Q12143 RTC3YHR087W 336 nt14.99□□□□□ -0.01
NSL1Q12143 CCC1YLR220W 969 nt14.9□□□□□ -0.02
NSL1Q12143 YOL085CYOL085C 342 nt14.66□□□□□ -0.06
NSL1Q12143 RVS167YDR388W 1449 nt14.66□□□□□ -0.06
NSL1Q12143 RPP1BYDL130W 321 nt14.61□□□□□ -0.07
NSL1Q12143 PKP1YIL042C 1185 nt14.49□□□□□ -0.09
NSL1Q12143 SCJ1YMR214W 1134 nt14.4□□□□□ -0.1
NSL1Q12143 PUT4YOR348C 1884 nt14.15□□□□□ -0.14
NSL1Q12143 SSA3YBL075C 1950 nt14.11□□□□□ -0.15
NSL1Q12143 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.09□□□□□ -0.15
NSL1Q12143 SHR5YOL110W 714 nt14□□□□□ -0.17
NSL1Q12143 PET122YER153C 765 nt13.99□□□□□ -0.17
NSL1Q12143 URN1YPR152C 1398 nt13.85□□□□□ -0.19
NSL1Q12143 SCR1SCR1 522 nt13.8□□□□□ -0.2
NSL1Q12143 ARE1YCR048W 1833 nt13.78□□□□□ -0.2
NSL1Q12143 DEP1YAL013W 1218 nt13.73□□□□□ -0.21
NSL1Q12143 SAH1YER043C 1350 nt13.72□□□□□ -0.21
NSL1Q12143 OPI9YLR338W 858 nt13.71□□□□□ -0.21
NSL1Q12143 POA1YBR022W 534 nt13.7□□□□□ -0.22
NSL1Q12143 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.64□□□□□ -0.23
NSL1Q12143 YDJ1YNL064C 1230 nt13.63□□□□□ -0.23
NSL1Q12143 RPN10YHR200W 807 nt13.61□□□□□ -0.23
NSL1Q12143 RRN5YLR141W 1092 nt13.55□□□□□ -0.24
NSL1Q12143 YNL208WYNL208W 600 nt13.49□□□□□ -0.25
NSL1Q12143 ATS1YAL020C 1002 nt13.48□□□□□ -0.25
NSL1Q12143 BSC6YOL137W 1494 nt13.48□□□□□ -0.25
NSL1Q12143 GAR1YHR089C 618 nt13.4□□□□□ -0.26
NSL1Q12143 PUN1YLR414C 792 nt13.34□□□□□ -0.27
NSL1Q12143 BUD23YCR047C 828 nt13.32□□□□□ -0.28
NSL1Q12143 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.27□□□□□ -0.29
NSL1Q12143 PTC2YER089C 1395 nt13.23□□□□□ -0.29
NSL1Q12143 YJR018WYJR018W 363 nt13.19□□□□□ -0.3
NSL1Q12143 RSB1YOR049C 1065 nt13.19□□□□□ -0.3
NSL1Q12143 NAB2YGL122C 1578 nt13.11□□□□□ -0.31
NSL1Q12143 SPT5YML010W 3192 nt13.04□□□□□ -0.32
NSL1Q12143 TIR1YER011W 765 nt12.97□□□□□ -0.33
NSL1Q12143 DAL1YIR027C 1383 nt12.87□□□□□ -0.35
NSL1Q12143 SSA1YAL005C 1929 nt12.86□□□□□ -0.35
NSL1Q12143 RPP2BYDR382W 333 nt12.86□□□□□ -0.35
NSL1Q12143 FIS1YIL065C 468 nt12.86□□□□□ -0.35
NSL1Q12143 FPR4YLR449W 1179 nt12.86□□□□□ -0.35
NSL1Q12143 YJR120WYJR120W 351 nt12.83□□□□□ -0.36
NSL1Q12143 SSA4YER103W 1929 nt12.82□□□□□ -0.36
NSL1Q12143 INM2YDR287W 879 nt12.78□□□□□ -0.36
NSL1Q12143 PHO4YFR034C 939 nt12.74□□□□□ -0.37
NSL1Q12143 MEP2YNL142W 1500 nt12.68□□□□□ -0.38
NSL1Q12143 YPS1YLR120C 1710 nt12.62□□□□□ -0.39
NSL1Q12143 YBL100CYBL100C 315 nt12.6□□□□□ -0.39
NSL1Q12143 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.54□□□□□ -0.4
NSL1Q12143 PST2YDR032C 597 nt12.53□□□□□ -0.4
NSL1Q12143 SRB2YHR041C 633 nt12.52□□□□□ -0.41
NSL1Q12143 BDH2YAL061W 1254 nt12.5□□□□□ -0.41
NSL1Q12143 YDR095CYDR095C 411 nt12.47□□□□□ -0.41
NSL1Q12143 DCW1YKL046C 1350 nt12.46□□□□□ -0.41
NSL1Q12143 FUN26YAL022C 1554 nt12.42□□□□□ -0.42
NSL1Q12143 ALF1YNL148C 765 nt12.37□□□□□ -0.43
NSL1Q12143 TRM9YML014W 840 nt12.35□□□□□ -0.43
NSL1Q12143 BDF1YLR399C 2061 nt12.33□□□□□ -0.44
NSL1Q12143 WWM1YFL010C 636 nt12.32□□□□□ -0.44
NSL1Q12143 YMR090WYMR090W 684 nt12.32□□□□□ -0.44
NSL1Q12143 EMI2YDR516C 1503 nt12.32□□□□□ -0.44
NSL1Q12143 LSM3YLR438C-A 270 nt12.27□□□□□ -0.45
NSL1Q12143 RPP2AYOL039W 321 nt12.25□□□□□ -0.45
NSL1Q12143 CCT6YDR188W 1641 nt12.22□□□□□ -0.45
NSL1Q12143 YDL221WYDL221W 552 nt12.19□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 PTP1YDL230W 1008 nt12.19□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.19□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.19□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 YBR220CYBR220C 1683 nt12.18□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 YGR021WYGR021W 873 nt12.17□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 CAC2YML102W 1407 nt12.17□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 TAT1YBR069C 1860 nt12.17□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.16□□□□□ -0.46
NSL1Q12143 SIS1YNL007C 1059 nt12.12□□□□□ -0.47
NSL1Q12143 SDH1YKL148C 1923 nt12.11□□□□□ -0.47
NSL1Q12143 SHU1YHL006C 453 nt12.11□□□□□ -0.47
NSL1Q12143 HOM6YJR139C 1080 nt12.06□□□□□ -0.48
NSL1Q12143 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.06□□□□□ -0.48
NSL1Q12143 SCC4YER147C 1875 nt12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms