RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W ASK1P35734 292 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W BIT2P38346 545 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W GUA1P38625 525 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W THO1P40040 218 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W IMA5P40884 581 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ELP2P42935 788 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ULI1P43604 169 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ACF4P47129 309 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W DIA3P52290 468 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PEX8P53248 589 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YGR117CP53270 476 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W TPO2P53283 614 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ECM9Q02202 377 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YOL019WQ08157 551 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SOG2Q08817 791 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W UIP4Q08926 304 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W CSR2Q12734 1121 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W CDC19P00549 500 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W CHS1P08004 1131 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W UGA1P17649 471 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W CCA1P21269 546 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W DMC1P25453 334 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data10.32□□□□□ -0.76not detected
PRP4YPR178W GLN1P32288 370 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W NDI1P32340 513 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W IXR1P33417 597 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PPE1P38796 400 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W NMD3P38861 518 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PRM2P40534 656 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PSP1P50896 841 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ALT2P52892 507 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W LSM3P57743 89 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W URC2Q04411 772 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ENT2Q05785 613 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ATG20Q07528 640 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SLD7Q08457 257 aa10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W HBS1P32769 611 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W GLC3P32775 704 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SRP101P32916 621 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W HSP78P33416 811 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YBR139WP38109 508 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W VPS29P38759 282 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W VAB2P40003 282 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PSP2P50109 593 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PEX31P53203 462 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YAF9P53930 226 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W NHX1Q04121 633 aa10.31□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W TPK3P05986 398 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data10.3□□□□□ -0.76not detected
PRP4YPR178W CMK2P22517 447 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PAH1P32567 862 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YBL029WP38201 376 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RIM11P38615 370 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W KRE29P40026 464 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W MAF1P41910 395 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RSN1Q03516 953 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RCF1Q03713 159 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W GAL83Q04739 417 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ARP9Q05123 467 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ARR1Q06596 294 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ECM30Q06673 1274 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YDL121CQ07541 149 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W FMP45Q07651 309 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W NTG2Q08214 380 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SGT1Q08446 395 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RSA1Q08932 381 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W REC8Q12188 680 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W MED11Q99278 115 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RIF1P29539 1916 aa10.3□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W DBR1P24309 405 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W APE2P32454 952 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W NUP2P32499 720 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PTH2P34222 208 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YHR112CP38716 378 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W VMA22P38784 181 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YJR061WP40355 935 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RTT101P47050 842 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W BNI4P53858 892 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SWP1Q02795 286 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PEX29Q03370 554 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YLR413WQ06689 675 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SGO1Q08490 590 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W NFI1Q12216 726 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W APM4Q99186 491 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SAS5Q99314 248 aa10.29□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W RPN13O13563 156 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W TPK1P06244 397 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SSA4P22202 642 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SRP68P38687 599 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PET100P38958 111 aa10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W AST2P39945 430 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W YEN1P40028 759 aa10.28□□□□□ -0.76
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