RNA–Protein interactions for RNA: YKR062W

TFA2, Transcript of TFIIE small subunit, yeast

Gene TFA2, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFA2	YKR062W	RAP1	P11938	827 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SPC97	P38863	823 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YJL107C	P42947	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	BNA1	P47096	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SEC5	P89102	971 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	VTC3	Q02725	835 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	RCO1	Q04779	684 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	PCT1	P13259	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	UBP13	P38187	747 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	FLO5	P38894	1075 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	AXL2	P38928	823 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	VRG4	P40107	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YJR061W	P40355	935 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	NNF2	P53253	936 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	BSC5	P53755	489 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	RSM28	Q03430	361 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SWF1	Q04629	336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SNO4	Q04902	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	TFC6	Q06339	672 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	HSP32	Q08992	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SPE2	P21182	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	CNA1	P23287	553 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	ESL2	P36168	1195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YIR016W	P40572	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	IME4	P41833	600 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YPT11	P48559	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	MUB1	Q03162	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YPR089W	O13585	888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YSP3	P25036	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	MRP20	P32387	263 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	ECM10	P39987	644 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	PCI8	P40512	444 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	CTK2	P46962	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	CHS3	P29465	1165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	ALY1	P36117	915 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	STV1	P37296	890 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	SWP82	P43554	623 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	PSR1	Q07800	427 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	TCO89	Q08921	799 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	HER1	Q12276	1246 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	RGT2	Q12300	763 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	ENT1	Q12518	454 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TFA2	YKR062W	GPA1	P08539	472 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	VMA16	P23968	213 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	CBF2	P32504	956 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	YBL029W	P38201	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	PSD1	P39006	500 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	VID27	P40157	782 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	SLZ1	P40167	298 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	CDC1	P40986	491 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	GAT1	P43574	510 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	MCM10	P32354	571 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	GEX2	P36173	615 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	AGP2	P38090	596 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	AFG3	P39925	761 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	TMA108	P40462	946 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	YFR020W	P43600	232 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	SMC3	P47037	1230 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	AAD10	P47182	288 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	ZDS2	P54786	942 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	PIG1	Q06216	648 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	MCP2	Q06567	569 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	APL4	Q12028	832 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	MGM1	P32266	881 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	YKL050C	P35736	922 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	PXL1	P36166	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	PKP1	P40530	394 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	MEP3	P53390	489 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	YNL234W	P53857	426 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	ATX2	Q12067	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	HUA2	Q12134	243 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	GAL4	P04386	881 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	PET111	P08468	800 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TFA2	YKR062W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms