RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YIM1	P28625	365 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YPK3	P38070	525 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RIM2	P38127	377 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YOL057W	Q08225	711 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SLX4	Q12098	748 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	BUD4	P47136	1447 aa		0.65	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CYB2	P00175	591 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CBP1	P07252	654 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	BUD14	P27637	709 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YLF2	P38746	405 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	STL1	P39932	569 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RPR2	P40571	144 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	TAM41	P53230	385 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CRF1	Q04930	467 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	POL1	P13382	1468 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SGS1	P35187	1447 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	GLN3	P18494	730 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	DGR2	P32330	852 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PHO90	P39535	881 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PEA2	P40091	420 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RTS2	P40962	232 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YNL181W	P53878	407 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	MHR1	Q06630	226 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ICL2	Q12031	575 aa		0.64	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	COX1	P00401	534 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ADH4	P10127	382 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	URK1	P27515	501 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	LAC1	P28496	418 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	EMP65	P40085	556 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YJR061W	P40355	935 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	VPS25	P47142	202 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YGL081W	P53156	320 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YNR061C	P53747	219 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ZDS2	P54786	942 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YTA7	P40340	1379 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PET111	P08468	800 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YJR142W	P47173	342 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	TIS11	P47977	285 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YLR152C	P54072	576 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	TFC6	Q06339	672 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	AAD4	Q07747	329 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YOL159C	Q08300	171 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PPT2	Q12036	173 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	BAG7	Q12128	409 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SUL2	Q12325	893 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YCR006C	P25350	157 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	GID7	P25569	745 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PDR3	P33200	976 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RGI2	P40188	164 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	IDP2	P41939	412 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YGL242C	P53066	181 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YGR079W	P53249	370 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YMR087W	Q04299	284 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	CRD1	Q07560	283 aa		0.63	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	POM152	P39685	1337 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SEC12	P11655	471 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PMR1	P13586	950 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	AGA1	P32323	725 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SWD1	P39706	426 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YTP1	P53584	459 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	RTT109	Q07794	436 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	ADR1	P07248	1323 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	GCN2	P15442	1659 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	YCR022C	P25620	114 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SWC3	P31376	625 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	MSS51	P32335	436 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	MDM31	P38880	579 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	VFA1	P40080	203 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	IAH1	P41734	238 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	SWP82	P43554	623 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	PMT3	P47190	753 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	UBP8	P50102	471 aa		0.62	□□□□□ -2.31
CSE1	YGL238W	COG6	P53959	839 aa		0.62	□□□□□ -2.31

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