RNA–Protein interactions for RNA: YBR215W

HPC2, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HPC2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPC2	YBR215W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	HOG1	P32485	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MAC1	P35192	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YHR045W	P38775	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VMA22	P38784	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YFR018C	P43599	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MDV1	P47025	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	COX16	P47081	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YSA1	Q01976	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	URH1	Q04179	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CRF1	Q04930	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VPS74	Q06385	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ESA1	Q08649	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	NMD4	Q12129	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	HUA2	Q12134	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SKM1	Q12469	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CTF3	Q12748	733 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	APM4	Q99186	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MTR10	Q99189	972 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RAD7	P06779	565 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ADH4	P10127	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	BET2	P20133	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SPE2	P21182	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YME1	P32795	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SLA2	P33338	968 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	FAT1	P38225	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	BRO1	P48582	844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YGR127W	P53275	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	AQR1	P53943	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	DIA1	P54005	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MRS2	Q01926	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	NGL3	Q03210	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RAD30	Q04049	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ARO80	Q04052	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ROY1	Q04847	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	REX4	Q08237	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	NCB2	Q92317	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VPS63	O13549	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YPR089W	O13585	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	NAM9	P27929	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ATP11	P32453	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	IXR1	P33417	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	TGL1	P34163	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	OAF3	P36023	863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SRO77	P38163	1010 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	TDA3	P38758	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	EAF5	P39995	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	TWF1	P53250	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GOR1	P53839	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SLT2	Q00772	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YHM2	Q04013	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	DCR2	Q05924	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MCH5	Q08777	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	AEP3	Q12089	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PSF3	Q12146	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
HPC2	YBR215W	NTO1	Q12311	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YOS9	Q99220	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	AFI1	Q99222	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	WHI2	P12611	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SIR1	P21691	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CPR5	P35176	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YKL063C	P35725	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CAF4	P36130	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RTT107	P38850	1070 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SSO2	P39926	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PRM2	P40534	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RGD2	P43556	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YGL176C	P46945	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ECL1	P48235	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	NIT3	P49954	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YNL143C	P53908	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	FYV6	P53913	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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