RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W ITR2P30606 609 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W VMA6P32366 345 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CYS4P32582 507 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CSE1P33307 960 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RCN1P36054 211 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W TDP1P38319 544 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YHR182WP38870 785 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W AVT2P39981 480 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W FIR1P40020 876 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W AVT6P40074 448 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YFL040WP43562 540 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YJR054WP47114 497 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RMR1P53060 241 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SLM2P53955 656 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MMT1Q03218 510 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MGR3Q04472 501 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W HDA3Q06623 655 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W VPS54Q12071 889 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W GPR1Q12361 961 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ERP3Q12403 225 aa10.37□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W TPK2P06245 380 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RHO1P06780 209 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RAP1P11938 827 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W HPR1P17629 752 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ERG6P25087 383 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W UTR2P32623 467 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W PEX6P33760 1030 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W PTC1P35182 281 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MAE1P36013 669 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W TBS1P38114 1094 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YBR241CP38142 488 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RFS1P38234 210 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YHB1P39676 399 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W GEM1P39722 662 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RRT5P43607 289 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W EAF6P47128 113 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YNL033WP53964 284 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YNL019CP53975 284 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ORC3P54790 616 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YEH2Q07950 538 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YOR389WQ08912 624 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YPR027CQ12079 277 aa10.36□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W POL30P15873 258 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W DOM34P33309 386 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YAT2P40017 923 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YER156CP40093 338 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MNN11P46985 422 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W IMA1P53051 589 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YGR127WP53275 312 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W VPS9P54787 451 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W PLP1Q04004 230 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RSB1Q08417 382 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ESA1Q08649 445 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data10.35□□□□□ -0.75not detected
PRP4YPR178W HFI1Q12060 488 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SCM3Q12334 223 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ZPS1Q12512 249 aa10.35□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W COX6P00427 148 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W MF(ALPHA)1P01149 165 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W THR1P17423 357 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W VPS3P23643 1011 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CAD1P24813 409 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SAT4P25333 603 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CTR86P25355 563 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RME1P32338 300 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W GCD11P32481 527 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W GDA1P32621 518 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W OCT1P35999 772 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W SKG1P36169 355 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YPK3P38070 525 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W IST2P38250 946 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W HSL7P38274 827 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YHL012WP38709 493 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YHI9P38765 294 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YHR054CP38780 354 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RSC30P38781 883 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W DSS1P39112 969 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YRB2P40517 327 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W JJJ3P47138 172 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W AIF1P52923 378 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YNL095CP53932 642 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W ADE12P80210 433 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W CSN9Q03981 162 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YDL073WQ07454 984 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W YLR125WQ12138 136 aa10.34□□□□□ -0.75
PRP4YPR178W NMT1P14743 455 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W ATP12P22135 325 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PHO91P27514 894 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W PRR1P28708 518 aa10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W SAC1P32368 623 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PRP4YPR178W DAL1P32375 460 aa10.33□□□□□ -0.76
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