RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MET7	Q08645	548 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TAF10	Q12030	206 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	GIS3	Q12418	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ATP4	P05626	244 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MIH1	P23748	554 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPC82	P32349	654 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TRM2	P33753	639 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PEA2	P40091	420 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ASG7	P46993	209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TPP1	Q03796	238 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YMR027W	Q04371	470 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ATG33	Q06485	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YDR018C	Q12185	396 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HMG1	P12683	1054 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YUR1	P26725	428 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HOG1	P32485	435 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PCA1	P38360	1216 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SAW1	P39735	261 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YER158C	P40095	573 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	GTR1	Q00582	310 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	OSW1	Q08692	278 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	EMP46	Q12396	444 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	KAR4	P25583	335 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	DPH2	P32461	534 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	BCS1	P32839	456 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SWH1	P35845	1188 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	FLR1	P38124	548 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MMS4	P38257	691 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SMF2	P38778	549 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SPC97	P38863	823 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	CKB2	P38930	258 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	FLC2	P39719	783 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ARG2	P40360	574 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SHE10	P53075	577 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MDR1	P53258	950 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YML119W	Q03208	357 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SPC24	Q04477	213 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PRM6	Q04705	352 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	THI7	Q05998	598 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YLR455W	Q06188	304 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	ECM7	Q06200	448 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	REH1	Q06709	432 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TRE2	Q08693	809 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YVC1	Q12324	675 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	COX4	P04037	155 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	GAL10	P04397	699 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	RAD3	P06839	778 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MPH2	P0CD99	609 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MAS2	P11914	482 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SLY1	P22213	666 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MRPL25	P23369	157 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	YCR015C	P25616	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	CDC20	P26309	610 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	PRR1	P28708	518 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MEI4	P29467	408 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MRP4	P32902	394 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	LRG1	P35688	1017 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	MSR1	P38714	643 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	STN1	P38960	494 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	TMA108	P40462	946 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	SNZ3	P43545	298 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	NIT2	P47016	307 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	NET1	P47035	1189 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	NNF2	P53253	936 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TRS33	YOR115C	BIO4	P53630	237 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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