RNA–Protein interactions for RNA: YOR106W

VAM3, Transcript of Syntaxin-like vacuolar t-SNARE, yeast

Gene VAM3, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAM3	YOR106W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	DJP1	P40564	432 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	CDC1	P40986	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	STB2	P46679	850 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	NUP53	Q03790	475 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	ATG23	Q06671	453 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	MCH4	Q08268	501 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	BAG7	Q12128	409 aa		5.04	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	PHO81	P17442	1178 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	ASG1	P40467	964 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	DSE3	Q08729	430 aa		5.03	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
VAM3	YOR106W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	BUD16	P39988	312 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	VPS25	P47142	202 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	MSY1	P48527	492 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	UBP8	P50102	471 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	BUD7	Q08754	746 aa		5.02	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	CLB4	P24871	460 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YCR006C	P25350	157 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YHL041W	P38730	149 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	MEP2	P41948	499 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	TRS130	Q03660	1102 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	SRL1	Q08673	210 aa		5.01	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	NUP120	P35729	1037 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	MRPL36	P36531	177 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YBR138C	P38277	524 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	PHM8	P40025	321 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	PUG1	P40100	303 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	ERR3	P42222	437 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	STP3	Q05937	343 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	PIG1	Q06216	648 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	GSH2	Q08220	491 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	SWT1	Q12104	458 aa		5	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	SWF1	Q04629	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	MLH2	Q07980	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	PCT1	P13259	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	VPS41	P38959	992 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YIL152W	P40455	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	SWA2	Q06677	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAM3	YOR106W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	GPA1	P08539	472 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	SPO16	P17122	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	PSF2	P40359	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	POS5	Q06892	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	FRE3	Q08905	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YSP3	P25036	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YCR043C	P25361	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	NPR3	P38742	1146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	IZH1	Q03419	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	CAC2	Q04199	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	MSM1	P22438	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	GCS1	P35197	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	LHS1	P36016	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	EXO84	P38261	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	ACA1	P39970	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YIL169C	P40442	995 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	GRS2	Q06817	618 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	UBP13	P38187	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	MET30	P39014	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YAT2	P40017	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	PCL6	P40038	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	MRX1	P40050	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	ECI1	Q05871	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	TPK1	P06244	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	NUC1	P08466	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YCL049C	P25577	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	MNN2	P38069	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	VRG4	P40107	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	ASE1	P50275	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	UBX4	P54730	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	PFA5	Q03289	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	CRN1	Q06440	651 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VAM3	YOR106W	COX17	Q12287	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.3 ms