RNA–Protein interactions for RNA: YKR101W

SIR1, Transcript of Protein involved in silencing at mating-type loci HML and HMR, yeast

Gene SIR1, Length 1,965 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIR1	YKR101W	LCL3	P53153	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SPC98	P53540	846 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	RNT1	Q02555	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	CBS1	P14066	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SWI3	P32591	825 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	RTS1	P38903	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	LTP1	P40347	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	TRS23	Q03784	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	ABF1	P14164	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	OPI1	P21957	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	RNQ1	P25367	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SRB5	P32585	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	LAM4	P38800	1345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	NPA3	P47122	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	RCN2	Q12044	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	NTO1	Q12311	748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	GRX6	Q12438	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	PDE1	P22434	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	PEP3	P27801	918 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	APL3	P38065	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	MAL33	P38157	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	RGI2	P40188	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	GLO1	P50107	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	ESC8	Q08119	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	PDX1	P16451	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SWP82	P43554	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	ATG4	P53867	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	UBP16	Q02863	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	ATG23	Q06671	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	COX1	P00401	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	PRE8	P23639	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	OCA4	P25366	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SUL1	P38359	859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	ERC1	P38767	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	CCT6	P39079	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SIR1	YKR101W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	REV3	P14284	1504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	TAF2	P23255	1407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	PXA2	P34230	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YML6	P51998	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	AIM39	Q08223	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	MDS3	P53094	1487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIR1	YKR101W	AAC1	P04710	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	PCT1	P13259	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	GDA1	P32621	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	LNP1	P38878	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	PMT6	P42934	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	MSY1	P48527	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	RIA1	P53893	1110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	ZDS2	P54786	942 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	CRN1	Q06440	651 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	HCM1	P25364	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	PEX5	P35056	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	HES1	P35843	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	MNN2	P38069	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	MET18	P40469	1032 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	THI6	P41835	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	JJJ1	P53863	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	YML037C	Q03703	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	YML053C	Q04978	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	YEH1	Q07804	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	LCB4	Q12246	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	YPT6	Q99260	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIR1	YKR101W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms