RNA–Protein interactions for RNA: YJR048W

CYC1, Transcript of Cytochrome c, isoform 1, yeast

Gene CYC1, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYC1	YJR048W	THI21	Q08975	551 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CYC1	YJR048W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CYC1	YJR048W	GPM3	Q12326	303 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CYC1	YJR048W	CTT1	P06115	562 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SPE1	P08432	466 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	BIK1	P11709	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	NTG1	P31378	399 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	COY1	P34237	679 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	UBP11	P36026	717 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	HEL1	P36113	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SEC9	P40357	651 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CAB2	P40506	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	SHE4	P51534	789 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RPN14	P53196	417 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	HDA1	P53973	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ORC4	P54791	529 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RAD30	Q04049	632 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	DON1	Q05610	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	FMP45	Q07651	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RIM20	Q12033	661 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	HER1	Q12276	1246 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	STE12	P13574	688 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MER1	P16523	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CPR2	P23285	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MRPL25	P23369	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YCR051W	P25631	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YHR054C	P38780	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CTM1	P38818	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YEL057C	P39983	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CEP3	P40969	608 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TCB2	P48231	1178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	COG1	P53079	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	NCS6	P53088	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TOF2	Q02208	771 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TAP42	Q04372	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YPS7	Q06325	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	HOS1	Q12214	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	LAS17	Q12446	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	URA3	P03962	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CWH43	P25618	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	REG2	P38232	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MUP3	P38734	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MRX1	P40050	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	EPL1	P43572	832 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	STU2	P46675	888 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YGR266W	P53326	701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ACS1	Q01574	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MAK10	Q02197	733 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MMR1	Q06324	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	STP4	Q07351	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	NPC2	Q12408	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ATG19	P35193	415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MRPL40	P36534	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	UBP13	P38187	747 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	RGI2	P40188	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MET28	P40573	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	GLO1	P50107	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	VPS4	P52917	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PUS2	P53167	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	PEF1	P53238	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	REG1	Q00816	1014 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	ATG21	Q02887	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	MCP2	Q06567	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CYC1	YJR048W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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