RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	GIS3	Q12418	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	BI2	P03873	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	POX1	P13711	748 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CBF1	P17106	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	KAR3	P17119	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	PRR1	P28708	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	PEX2	P32800	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MMS21	P38632	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	END3	P39013	349 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	USA1	Q03714	838 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	UFO1	Q04511	668 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ENT2	Q05785	613 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ECM7	Q06200	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	NKP1	Q12493	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RIF1	P29539	1916 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RGT1	P32862	1170 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	REC104	P33323	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	OAF3	P36023	863 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MMS4	P38257	691 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	VHC1	P38329	1120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MSG5	P38590	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	TOK1	P40310	691 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SAP185	P40856	1058 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	PFD1	P46988	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	URB2	P47108	1174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	PUS2	P53167	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	RNT1	Q02555	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	EAF1	Q06337	982 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SDH5	Q08230	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	HFI1	Q12060	488 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	HIF1	Q12373	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LOH1	YJL038C	COX4	P04037	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	RAD10	P06838	210 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	WHI2	P12611	486 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	CLB1	P24868	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	PLC1	P32383	869 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	STE14	P32584	239 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	TMN3	P40071	706 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	YMR134W	P40207	237 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	INA22	P40576	216 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	ASG7	P46993	209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	ALY2	P47029	1046 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	IVY1	Q04934	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	PIG1	Q06216	648 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	CDD1	Q06549	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	FMP25	Q08023	583 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	SEY1	Q99287	776 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	QCR6	P00127	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	ADH4	P10127	382 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	PEP5	P12868	1029 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	PMS1	P14242	873 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	POL3	P15436	1097 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	SPO16	P17122	198 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	SFL1	P20134	766 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	AEP2	P22136	580 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	ERG4	P25340	473 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	BCS1	P32839	456 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	CCL1	P37366	393 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	KHA1	P40309	873 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LOH1	YJL038C	TRS85	P46944	698 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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