RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	SWF1	Q04629	336 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	POS5	Q06892	414 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	SCC2	Q04002	1493 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	VPS41	P38959	992 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	UBP12	P39538	1254 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	SAW1	P39735	261 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	YND1	P40009	630 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	UBX6	P47049	396 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	YPR003C	P53394	754 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	CAC2	Q04199	468 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	PIG1	Q06216	648 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	AIM6	Q07716	390 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	TAH18	Q12181	623 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	MYO4	P32492	1471 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SYS1	YJL004C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	IZH1	Q03419	316 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	PHM6	Q05637	104 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	AAD4	Q07747	329 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SPT7	P35177	1332 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	TAF2	P23255	1407 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SRB8	P25648	1427 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	BUD4	P47136	1447 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	HES1	P35843	434 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	NUR1	Q12066	484 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	IRC20	Q06554	1556 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SSM4	P40318	1319 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	COX1	P00401	534 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	ARP9	Q05123	467 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YCR006C	P25350	157 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	TCB2	P48231	1178 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YMR254C	Q04838	102 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	CDC23	P16522	626 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SDS24	P38314	527 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SWD1	P39706	426 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	PHM8	P40025	321 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YEN1	P40028	759 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	ASG1	P40467	964 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YGR079W	P53249	370 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	COG6	P53959	839 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	CRZ1	P53968	678 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SND1	Q04007	877 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	TIP41	Q12199	356 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	TMA17	Q12513	150 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	GCN2	P15442	1659 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	RKR1	Q04781	1562 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YOR1	P53049	1477 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	ADH4	P10127	382 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	IMA5	P40884	581 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	CUL3	P53202	744 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	ESBP6	P53918	673 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	GTB1	Q04924	702 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	FRE3	Q08905	711 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	ULS1	Q08562	1619 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SYS1	YJL004C	IME2	P32581	645 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	EFM2	P38347	419 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	IML2	P47031	731 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YNL181W	P53878	407 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	BAG7	Q12128	409 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	PAN1	P32521	1480 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	GPA1	P08539	472 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TFC4	P33339	1025 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YOX1	P34161	385 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YBR139W	P38109	508 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YJL070C	P40361	888 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ASK10	P48361	1146 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	PEX14	P53112	341 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	DOS2	P54858	310 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YPK9	Q12697	1472 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	SMC4	Q12267	1418 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	CBP1	P07252	654 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	CLC1	P17891	233 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	HNM1	P19807	563 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	RAD24	P32641	659 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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