RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	STE12	P13574	688 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CLB3	P24870	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	OCA4	P25366	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MRE11	P32829	692 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MRPL40	P36534	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ALG3	P38179	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YBR138C	P38277	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	COS111	P38308	924 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YHR054C	P38780	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PSD1	P39006	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YJL070C	P40361	888 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	NAS2	P40555	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MAK10	Q02197	733 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	GTB1	Q04924	702 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DON1	Q05610	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CRR1	Q05790	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CTI6	Q08923	506 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	HER1	Q12276	1246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YLR302C	O13544	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	NFS1	P25374	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DGR2	P32330	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	AFR1	P33304	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	GPT2	P36148	743 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YKR075C	P36155	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TAF5	P38129	798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YBL029W	P38201	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YBL028C	P38202	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RGD1	P38339	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PKP1	P40530	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	VID28	P40547	921 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SHR5	P41912	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	FET5	P43561	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SHE4	P51534	789 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RPN14	P53196	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MEC3	Q02574	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RBA50	Q04418	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	FMP45	Q07651	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RRT8	Q08219	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	HMI1	Q12039	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RCN2	Q12044	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	NBP2	Q12163	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CDC42	P19073	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	VPS3	P23643	1011 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	HXT4	P32467	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	KRE6	P32486	720 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DOA4	P32571	926 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YEL043W	P32618	956 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	ELM1	P32801	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YKR051W	P36142	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DAD2	P36162	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YIL089W	P40500	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PXA1	P41909	870 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	SLS1	P42900	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	VID30	P53076	958 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	LCL3	P53153	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	HOP2	P53187	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MDR1	P53258	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YSA1	Q01976	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TFC6	Q06339	672 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	CIR2	Q08822	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	COX17	Q12287	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	AVL9	Q12500	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	PTC5	Q12511	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	DIF1	O13577	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRA2	YKL214C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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