RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	PLM2	Q04383	521 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YMR254C	Q04838	102 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GUD1	Q07729	489 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CRT10	Q08226	957 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RRI1	Q12468	440 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BPT1	P14772	1559 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YSP3	P25036	478 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SFP1	P32432	683 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	OCT1	P35999	772 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SCO2	P38072	301 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PCA1	P38360	1216 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YHR218W	P38899	603 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GUF1	P46943	645 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YPL191C	Q08930	360 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GPA1	P08539	472 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	LSB5	P25369	354 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	HXT1	P32465	570 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MNN1	P39106	762 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PHM8	P40025	321 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TFB2	Q02939	513 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ADD37	Q03233	198 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YLR281C	Q05863	155 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YOR378W	Q08902	515 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	HNM1	P19807	563 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YEL068C	P39977	110 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MAM1	P40065	302 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SHE10	P53075	577 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ASI1	P54074	624 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RPM2	Q02773	1202 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	MMS1	Q06211	1407 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	URA3	P03962	267 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PMS1	P14242	873 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SAN1	P22470	610 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	STE50	P25344	346 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	LDB16	P25587	256 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YKR075C	P36155	307 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	HXT9	P40885	567 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	FET5	P43561	622 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	POL31	P46957	487 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	NPA3	P47122	385 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	FRE3	Q08905	711 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YLR112W	Q12130	139 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	VPS5	Q92331	675 aa		0.7	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BAR1	P12630	587 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PTC6	P25646	442 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DAL3	P32459	195 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YER130C	P39959	443 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GSM1	P42950	618 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	NNF1	P47149	201 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	COS10	P52924	374 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	AIM41	Q12032	185 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RKR1	Q04781	1562 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SPR1	P32603	445 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	NIC96	P34077	839 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YHR033W	P38690	423 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	STB5	P38699	743 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TDA3	P38758	523 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	EAF5	P39995	279 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	IML2	P47031	731 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	COG2	P53271	262 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	FMP42	Q04991	504 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	AIM6	Q07716	390 aa		0.69	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CPR3	P25719	182 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	THI4	P32318	326 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SPC34	P36131	295 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RRT2	P38332	387 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YDL186W	P48568	277 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ORC5	P50874	479 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	TIP41	Q12199	356 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	CHO1	P08456	276 aa		0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	DID4	P36108	232 aa		0.68	□□□□□ -2.3

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