RNA–Protein interactions for RNA: YFL033C

RIM15, Transcript of Protein kinase involved in cell proliferation in response to nutrients, yeast

Gene RIM15, Length 5,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM15	YFL033C	PRR1	P28708	518 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	CTF13	P35203	478 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	PLP1	Q04004	230 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	MCP2	Q06567	569 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ATG20	Q07528	640 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	UAF30	Q08747	228 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RPN6	Q12377	434 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	CCA1	P21269	546 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RDH54	P38086	958 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RFC3	P38629	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SIW14	P53965	281 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YMR187C	Q03236	431 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	MED2	Q12124	431 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	HUA2	Q12134	243 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	MRP21	P38175	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	TMN3	P40071	706 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	TIM54	P47045	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	CLD1	P53264	445 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	BIO4	P53630	237 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	URA4	P20051	364 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	DCC1	P25559	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RGT1	P32862	1170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	DRE2	P36152	348 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YBR063C	P38083	404 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SFB3	P38810	929 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SLX8	P40072	274 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YGR053C	P53234	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
RIM15	YFL033C	TAF9	Q05027	157 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YLR346C	Q06139	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SUE1	Q06524	206 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	PRP28	P23394	588 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	PET127	P32606	800 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SLA2	P33338	968 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SEC66	P33754	206 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	HSL7	P38274	827 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YHL050C	P38721	697 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	HAT2	P39984	401 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SPC105	P53148	917 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RPM2	Q02773	1202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YDR018C	Q12185	396 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	KCS1	Q12494	1050 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	NAM9	P27929	486 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YHR054C	P38780	354 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RSM7	P47150	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ORC4	P54791	529 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YML020W	Q03722	664 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	TAF12	Q03761	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	FIN1	Q03898	291 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	BCH1	Q05029	724 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SPH1	Q06160	661 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	DDC1	Q08949	612 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	CNA1	P23287	553 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ADY2	P25613	283 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ETR1	P38071	380 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YBR062C	P38239	180 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YHR045W	P38775	560 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	RRN7	P40992	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	MON1	P53129	644 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YTP1	P53584	459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	BOP3	P53958	396 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	MDM36	Q06820	579 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	YET3	Q07451	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SCM3	Q12334	223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	HXT1	P32465	570 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	UTR4	P32626	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	CYC2	P38909	366 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	CDC55	Q00362	526 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	TFB4	Q12004	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ATG29	Q12092	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SFM1	Q12314	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	ABF1	P14164	731 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	PIM1	P36775	1133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	TDP1	P38319	544 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	FAA2	P39518	744 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	FLC2	P39719	783 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RIM15	YFL033C	SIP4	P46954	829 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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