Protein–RNA interactions for Protein: Q12035

FCF2, rRNA-processing protein FCF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FCF2Q12035 NSR1YGR159C 1245 nt16.81■□□□□ 0.28
FCF2Q12035 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.3■□□□□ 0.2
FCF2Q12035 NOP1YDL014W 984 nt15.72■□□□□ 0.11
FCF2Q12035 MDJ1YFL016C 1536 nt15.33■□□□□ 0.04
FCF2Q12035 YJL027CYJL027C 417 nt14.17□□□□□ -0.14
FCF2Q12035 YKL036CYKL036C 393 nt13.93□□□□□ -0.18
FCF2Q12035 SRX1YKL086W 384 nt13.72□□□□□ -0.21
FCF2Q12035 Q0297Q0297 156 nt13.58□□□□□ -0.24
FCF2Q12035 DBP2YNL112W 1641 nt13.37□□□□□ -0.27
FCF2Q12035 YBR190WYBR190W 312 nt13.34□□□□□ -0.27
FCF2Q12035 SSA3YBL075C 1950 nt13.08□□□□□ -0.32
FCF2Q12035 RTC3YHR087W 336 nt12.91□□□□□ -0.34
FCF2Q12035 YCR051WYCR051W 669 nt12.88□□□□□ -0.35
FCF2Q12035 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.73□□□□□ -0.37
FCF2Q12035 RVS167YDR388W 1449 nt12.51□□□□□ -0.41
FCF2Q12035 PUT4YOR348C 1884 nt12.51□□□□□ -0.41
FCF2Q12035 CCC1YLR220W 969 nt12.48□□□□□ -0.41
FCF2Q12035 SCS3YGL126W 1143 nt12.33□□□□□ -0.44
FCF2Q12035 SCJ1YMR214W 1134 nt12.23□□□□□ -0.45
FCF2Q12035 RPP1BYDL130W 321 nt12.15□□□□□ -0.46
FCF2Q12035 ARE1YCR048W 1833 nt12.09□□□□□ -0.47
FCF2Q12035 YOL085CYOL085C 342 nt12.05□□□□□ -0.48
FCF2Q12035 POA1YBR022W 534 nt12.02□□□□□ -0.49
FCF2Q12035 SHR5YOL110W 714 nt11.94□□□□□ -0.5
FCF2Q12035 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.92□□□□□ -0.5
FCF2Q12035 OPI9YLR338W 858 nt11.91□□□□□ -0.5
FCF2Q12035 URN1YPR152C 1398 nt11.91□□□□□ -0.5
FCF2Q12035 BSC6YOL137W 1494 nt11.89□□□□□ -0.51
FCF2Q12035 SAH1YER043C 1350 nt11.89□□□□□ -0.51
FCF2Q12035 PKP1YIL042C 1185 nt11.84□□□□□ -0.51
FCF2Q12035 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.83□□□□□ -0.52
FCF2Q12035 SPT5YML010W 3192 nt11.81□□□□□ -0.52
FCF2Q12035 RPN10YHR200W 807 nt11.69□□□□□ -0.54
FCF2Q12035 SSA4YER103W 1929 nt11.65□□□□□ -0.54
FCF2Q12035 DEP1YAL013W 1218 nt11.65□□□□□ -0.54
FCF2Q12035 PET122YER153C 765 nt11.62□□□□□ -0.55
FCF2Q12035 PUN1YLR414C 792 nt11.58□□□□□ -0.56
FCF2Q12035 BUD23YCR047C 828 nt11.57□□□□□ -0.56
FCF2Q12035 YNL208WYNL208W 600 nt11.54□□□□□ -0.56
FCF2Q12035 YDJ1YNL064C 1230 nt11.52□□□□□ -0.57
FCF2Q12035 PTC2YER089C 1395 nt11.45□□□□□ -0.58
FCF2Q12035 NAB2YGL122C 1578 nt11.44□□□□□ -0.58
FCF2Q12035 SCR1SCR1 522 nt11.41□□□□□ -0.58
FCF2Q12035 YJL225CYJL225C 5277 nt11.38□□□□□ -0.59
FCF2Q12035 YJR018WYJR018W 363 nt11.35□□□□□ -0.59
FCF2Q12035 BDF1YLR399C 2061 nt11.28□□□□□ -0.6
FCF2Q12035 MEP2YNL142W 1500 nt11.26□□□□□ -0.61
FCF2Q12035 GAR1YHR089C 618 nt11.24□□□□□ -0.61
FCF2Q12035 RRN5YLR141W 1092 nt11.23□□□□□ -0.61
FCF2Q12035 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.2□□□□□ -0.62
FCF2Q12035 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.2□□□□□ -0.62
FCF2Q12035 FIS1YIL065C 468 nt11.18□□□□□ -0.62
FCF2Q12035 DAL1YIR027C 1383 nt11.16□□□□□ -0.62
FCF2Q12035 TAT1YBR069C 1860 nt11.14□□□□□ -0.63
FCF2Q12035 INM2YDR287W 879 nt11.07□□□□□ -0.64
FCF2Q12035 YPS1YLR120C 1710 nt11.05□□□□□ -0.64
FCF2Q12035 PHO4YFR034C 939 nt11.04□□□□□ -0.64
FCF2Q12035 FPR4YLR449W 1179 nt11.03□□□□□ -0.64
FCF2Q12035 YJR120WYJR120W 351 nt11.01□□□□□ -0.65
FCF2Q12035 RPP2BYDR382W 333 nt11□□□□□ -0.65
FCF2Q12035 YER088W-BYER088W-B 147 nt11□□□□□ -0.65
FCF2Q12035 DCW1YKL046C 1350 nt10.99□□□□□ -0.65
FCF2Q12035 YMR090WYMR090W 684 nt10.94□□□□□ -0.66
FCF2Q12035 TIR1YER011W 765 nt10.93□□□□□ -0.66
FCF2Q12035 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.93□□□□□ -0.66
FCF2Q12035 YDR095CYDR095C 411 nt10.91□□□□□ -0.66
FCF2Q12035 EMI2YDR516C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
FCF2Q12035 YBR220CYBR220C 1683 nt10.89□□□□□ -0.67
FCF2Q12035 ATS1YAL020C 1002 nt10.89□□□□□ -0.67
FCF2Q12035 SSA1YAL005C 1929 nt10.88□□□□□ -0.67
FCF2Q12035 RSB1YOR049C 1065 nt10.82□□□□□ -0.68
FCF2Q12035 YBL100CYBL100C 315 nt10.81□□□□□ -0.68
FCF2Q12035 PAC11YDR488C 1602 nt10.8□□□□□ -0.68
FCF2Q12035 YDL221WYDL221W 552 nt10.78□□□□□ -0.68
FCF2Q12035 SDH1YKL148C 1923 nt10.76□□□□□ -0.69
FCF2Q12035 NVJ2YPR091C 2313 nt10.74□□□□□ -0.69
FCF2Q12035 RPP2AYOL039W 321 nt10.69□□□□□ -0.7
FCF2Q12035 SEC11YIR022W 504 nt10.68□□□□□ -0.7
FCF2Q12035 BDH2YAL061W 1254 nt10.68□□□□□ -0.7
FCF2Q12035 PTP1YDL230W 1008 nt10.67□□□□□ -0.7
FCF2Q12035 FUN26YAL022C 1554 nt10.66□□□□□ -0.7
FCF2Q12035 CAC2YML102W 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
FCF2Q12035 PCH2YBR186W 1695 nt10.64□□□□□ -0.71
FCF2Q12035 ALF1YNL148C 765 nt10.64□□□□□ -0.71
FCF2Q12035 SCC4YER147C 1875 nt10.59□□□□□ -0.71
FCF2Q12035 GUT2YIL155C 1950 nt10.59□□□□□ -0.71
FCF2Q12035 FPS1YLL043W 2010 nt10.58□□□□□ -0.72
FCF2Q12035 TRM9YML014W 840 nt10.56□□□□□ -0.72
FCF2Q12035 SIS1YNL007C 1059 nt10.52□□□□□ -0.73
FCF2Q12035 IRC15YPL017C 1500 nt10.52□□□□□ -0.73
FCF2Q12035 SRB2YHR041C 633 nt10.51□□□□□ -0.73
FCF2Q12035 CCT6YDR188W 1641 nt10.51□□□□□ -0.73
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