RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PEX6P33760 1030 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YKL050CP35736 922 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W FMO1P38866 432 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W POP2P39008 433 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W GCN20P43535 752 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YGR153WP48238 217 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YGL242CP53066 181 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YGR021WP53212 290 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MTL1P53214 551 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ATG4P53867 494 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ALF1P53904 254 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W INA17Q02888 182 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W HOT1Q03213 719 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MCP2Q06567 569 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SPO75Q07798 868 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MLH2Q07980 695 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ATP16Q12165 160 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TRM732Q03496 1420 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PGK1P00560 416 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ATP4P05626 244 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TAL1P15019 335 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TUP1P16649 713 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ARE1P25628 610 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W NIP1P32497 812 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TFC4P33339 1025 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MTC2P34246 357 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W HEL1P36113 551 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W POP7P38291 140 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W FZO1P38297 855 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YHR131CP38835 850 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RCY1P39531 840 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W VID27P40157 782 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W LTP1P40347 161 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W BUD6P41697 788 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W AGX1P43567 385 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W GYP8P43570 497 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W FYV8P46949 817 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W NET1P47035 1189 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ILM1P47155 203 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W VMA10P48836 114 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ZIP2P53061 704 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YNL193WP53870 558 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W COG6P53959 839 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MUB1Q03162 620 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W DCS1Q06151 350 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W VPS36Q06696 566 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W VHS3Q08438 674 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PGC1Q08959 321 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W IES3Q12345 250 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YKL068W-AQ3E826 78 aa3.55□□□□□ -1.84
VFA1YER128W NUP170P38181 1502 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YMR084WA2P2R3 262 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RPC40P07703 335 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ERG11P10614 530 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W REC107P21651 314 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RDS1P25611 832 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SRB4P32569 687 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PHO11P35842 467 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PHO12P38693 467 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MSR1P38714 643 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MUP3P38734 546 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W DSS1P39112 969 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PCI8P40512 444 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SAP185P40856 1058 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W STB1P42845 420 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W UBP6P43593 499 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W BNA6P43619 295 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W HAM1P47119 197 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SAP4P53036 818 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W FHN1P53279 174 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ESBP6P53918 673 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RPM2Q02773 1202 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YDR514CQ04408 483 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W IVY1Q04934 453 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SPC2Q04969 178 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YDR286CQ05530 114 aa3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
VFA1YER128W BUG1Q12191 341 aa3.54□□□□□ -1.84
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