RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10352B2RWR6 380 aa6.72□□□□□ -1.33
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbmy1a1O35698 380 aa6.72□□□□□ -1.33
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01794 123 aa6.72□□□□□ -1.33
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PlnP61014 52 aa6.72□□□□□ -1.33
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbmy1bQ60990 380 aa6.72□□□□□ -1.33
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9D727 114 aa6.72□□□□□ -1.33
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SpxD3Z752 116 aa6.71□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav13-2A0A075B649 110 aa6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LeprotO89013 131 aa6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defa4P28311 92 aa6.7□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9130204L05RikG3UWB8 92 aa6.69□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cib3Q0P523 160 aa6.69□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erg28Q9ERY9 140 aa6.69□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P84750 121 aa6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defa20Q45VN2 95 aa6.68□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Josd1Q9DBJ6 202 aa6.67□□□□□ -1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm42420A0A0J9YUQ2 99 aa6.66□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smim29Q8R043 75 aa6.65□□□□□ -1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chchd1Q9CQA6 118 aa6.65□□□□□ -1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Reg3dQ9QUS9 175 aa6.65□□□□□ -1.34
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2d4D3YUH6 135 aa6.64□□□□□ -1.35
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb39Q70KL3 74 aa6.64□□□□□ -1.35
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gatd1Q8BFQ8 220 aa6.64□□□□□ -1.35
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930544G11RikQ9CR99 193 aa6.64□□□□□ -1.35
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm28269A0A087WSG3 125 aa6.63□□□□□ -1.35
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5965D3Z724 196 aa6.63□□□□□ -1.35
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb12Q8K4N3 78 aa6.62□□□□□ -1.35
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgs21V9GXQ3 152 aa6.57□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11011D3Z3L9 86 aa6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex54G3UW99 86 aa6.56□□□□□ -1.36
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Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2bhQ64478 126 aa6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist2h2bbQ64525 126 aa6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A930004D18RikQ8C8W7 157 aa6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700011M02RikB1AX35 88 aa6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01837 106 aa6.54□□□□□ -1.36
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