Protein–RNA interactions for Protein: G3UWB8

9130204L05Rik, MCG121122, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130204L05RikG3UWB8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
9130204L05RikG3UWB8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
9130204L05RikG3UWB8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
9130204L05RikG3UWB8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
9130204L05RikG3UWB8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
9130204L05RikG3UWB8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
9130204L05RikG3UWB8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
9130204L05RikG3UWB8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
9130204L05RikG3UWB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
9130204L05RikG3UWB8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
9130204L05RikG3UWB8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
9130204L05RikG3UWB8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,56■■□□□ 1,36
9130204L05RikG3UWB8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
9130204L05RikG3UWB8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
9130204L05RikG3UWB8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
9130204L05RikG3UWB8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
9130204L05RikG3UWB8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
9130204L05RikG3UWB8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
9130204L05RikG3UWB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
9130204L05RikG3UWB8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
9130204L05RikG3UWB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
9130204L05RikG3UWB8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
9130204L05RikG3UWB8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
9130204L05RikG3UWB8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
9130204L05RikG3UWB8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
9130204L05RikG3UWB8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,83■■□□□ 1,24
9130204L05RikG3UWB8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
9130204L05RikG3UWB8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
9130204L05RikG3UWB8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
9130204L05RikG3UWB8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
9130204L05RikG3UWB8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,55■■□□□ 1,2
9130204L05RikG3UWB8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
9130204L05RikG3UWB8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,41■■□□□ 1,18
9130204L05RikG3UWB8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
9130204L05RikG3UWB8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
9130204L05RikG3UWB8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
9130204L05RikG3UWB8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
9130204L05RikG3UWB8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,27■■□□□ 1,16
9130204L05RikG3UWB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
9130204L05RikG3UWB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
9130204L05RikG3UWB8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,21■■□□□ 1,15
9130204L05RikG3UWB8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
9130204L05RikG3UWB8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
9130204L05RikG3UWB8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
9130204L05RikG3UWB8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
9130204L05RikG3UWB8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
9130204L05RikG3UWB8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
9130204L05RikG3UWB8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,1
9130204L05RikG3UWB8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
9130204L05RikG3UWB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
9130204L05RikG3UWB8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
9130204L05RikG3UWB8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
9130204L05RikG3UWB8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
9130204L05RikG3UWB8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
9130204L05RikG3UWB8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
9130204L05RikG3UWB8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
9130204L05RikG3UWB8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
9130204L05RikG3UWB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
9130204L05RikG3UWB8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
9130204L05RikG3UWB8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
9130204L05RikG3UWB8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
9130204L05RikG3UWB8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,55■■□□□ 1,04
9130204L05RikG3UWB8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
9130204L05RikG3UWB8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
9130204L05RikG3UWB8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
9130204L05RikG3UWB8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
9130204L05RikG3UWB8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
9130204L05RikG3UWB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,38■■□□□ 1,01
9130204L05RikG3UWB8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
9130204L05RikG3UWB8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
9130204L05RikG3UWB8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
9130204L05RikG3UWB8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
9130204L05RikG3UWB8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
9130204L05RikG3UWB8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
9130204L05RikG3UWB8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
9130204L05RikG3UWB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
9130204L05RikG3UWB8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
9130204L05RikG3UWB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
9130204L05RikG3UWB8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
9130204L05RikG3UWB8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
9130204L05RikG3UWB8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
9130204L05RikG3UWB8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
9130204L05RikG3UWB8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
9130204L05RikG3UWB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
9130204L05RikG3UWB8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
9130204L05RikG3UWB8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
9130204L05RikG3UWB8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
9130204L05RikG3UWB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,12■□□□□ 0,97
9130204L05RikG3UWB8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
9130204L05RikG3UWB8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
9130204L05RikG3UWB8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
9130204L05RikG3UWB8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
9130204L05RikG3UWB8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,7 ms