RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ammecr1lQ8JZZ6 310 aa17.29■□□□□ 0.36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trav3n-3A0A0G2JEM0 114 aa17.28■□□□□ 0.36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gng4P50153 75 aa17.28■□□□□ 0.36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tomm6Q9CQN3 74 aa17.28■□□□□ 0.36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pam16Q9CQV1 125 aa17.28■□□□□ 0.36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rpl39P62892 51 aa17.27■□□□□ 0.36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Leap2Q91V13 76 aa17.27■□□□□ 0.36
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm7257D3YX25 99 aa17.27■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cmc4Q61908 68 aa17.27■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm28044L7N1X0 119 aa17.26■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 PlnP61014 52 aa17.26■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 TnxbO35452 4006 aa17.26■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa17.25■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Esp3J3QN49 87 aa17.25■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 OdaphJ3QNT8 126 aa17.25■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10130F6ZHM5 101 aa17.24■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa17.24■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 TtrP07309 147 aa17.23■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa17.22■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pmp2P24526 132 aa17.22■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm5868Q8BJG1 145 aa17.22■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 BC025920Q3US60 128 aa17.21■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa17.21■□□□□ 0.35
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm20458E9PXJ7 78 aa17.2■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa17.2■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tex48Q9DA81 110 aa17.2■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Spry2Q9QXV8 315 aa17.2■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa17.19■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 NpsP0C0P8 89 aa17.19■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp5lQ9CPQ8 103 aa17.19■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trav9d-3A0A075B695 113 aa17.19■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa17.17■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm28305F6U473 122 aa17.17■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 TcraP01849 138 aa17.17■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 F11rO88792 300 aa17.16■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 SeboxP70368 190 aa17.16■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rnf114Q9ET26 229 aa17.16■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Phlda3Q9WV95 125 aa17.16■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 P01794 123 aa17.16■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa17.15■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 FcorP0DJI6 106 aa17.15■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ube2d3P61079 147 aa17.15■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ube2d2P62838 147 aa17.15■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Foxc1Q61572 553 aa17.15■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm5148Q8BGG2 154 aa17.15■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 March3Q8BRX9 218 aa17.15■□□□□ 0.34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm17472A0A075B683 117 aa17.13■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 P01745 121 aa17.13■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cox8bP48772 70 aa17.13■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa17.13■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa17.12■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Higd2aQ9CQJ1 106 aa17.12■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nat8b-psE0CYC6 232 aa17.12■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa17.11■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 P18527 97 aa17.11■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gng7Q61016 68 aa17.11■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm21693J3QK27 380 aa17.11■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cox7a1P56392 80 aa17.11■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trav13d-1A0A075B606 110 aa17.1■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa17.1■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tcrg-C3L7N479 172 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppp1r32Q148A4 427 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hist2h2beQ64524 126 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ube2cQ9D1C1 179 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Igkv4-61A0A0G2JH00 117 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dad1P61804 113 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cend1Q9JKC6 149 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tcf24V9GWT9 166 aa17.09■□□□□ 0.33
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lcn2P11672 200 aa17.08■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm9513B3GLJ6 99 aa17.07■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ifitm1Q9D103 106 aa17.07■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Chac1Q8R3J5 223 aa17.06■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem101Q91VP7 257 aa17.06■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prss29Q99MS4 279 aa17.06■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm904Q3V2L5 102 aa17.06■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q5BN45 167 aa17.06■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pradc1Q9D9N8 188 aa17.06■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dnah3Q8BW94 4083 aa17.05■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam19a4Q7TPG5 135 aa17.05■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Spink4O35679 86 aa17.05■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 P01729 129 aa17.05■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem170bP86050 132 aa17.05■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Malsu1Q9CWV0 228 aa17.05■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Spink1P09036 80 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cox7a2lQ61387 111 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 TirapQ99JY1 241 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Timm17aQ9Z0V8 171 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10772F7AIG4 85 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ca1P13634 261 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cib3Q0P523 160 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Klk9Q32M27 251 aa17.04■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa17.03■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm21370Q3T9V6 190 aa17.03■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sh2d1aO88890 126 aa17.02■□□□□ 0.32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Higd1aQ9JLR9 95 aa17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75.1 ms