Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
TcraP01849 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
TcraP01849 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
TcraP01849 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
TcraP01849 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
TcraP01849 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
TcraP01849 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
TcraP01849 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
TcraP01849 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
TcraP01849 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
TcraP01849 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
TcraP01849 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
TcraP01849 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
TcraP01849 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
TcraP01849 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
TcraP01849 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
TcraP01849 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
TcraP01849 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
TcraP01849 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,78■■□□□ 1,08
TcraP01849 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
TcraP01849 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,52■■□□□ 1,04
TcraP01849 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
TcraP01849 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
TcraP01849 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
TcraP01849 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
TcraP01849 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
TcraP01849 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
TcraP01849 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,99
TcraP01849 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
TcraP01849 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
TcraP01849 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
TcraP01849 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
TcraP01849 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
TcraP01849 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
TcraP01849 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
TcraP01849 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
TcraP01849 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
TcraP01849 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
TcraP01849 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
TcraP01849 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
TcraP01849 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
TcraP01849 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
TcraP01849 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
TcraP01849 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
TcraP01849 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
TcraP01849 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,73■□□□□ 0,91
TcraP01849 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
TcraP01849 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
TcraP01849 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,66■□□□□ 0,9
TcraP01849 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
TcraP01849 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
TcraP01849 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,63■□□□□ 0,89
TcraP01849 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
TcraP01849 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
TcraP01849 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
TcraP01849 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
TcraP01849 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
TcraP01849 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
TcraP01849 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
TcraP01849 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
TcraP01849 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
TcraP01849 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,25■□□□□ 0,83
TcraP01849 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,24■□□□□ 0,83
TcraP01849 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
TcraP01849 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
TcraP01849 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
TcraP01849 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
TcraP01849 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
TcraP01849 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
TcraP01849 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
TcraP01849 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
TcraP01849 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
TcraP01849 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
TcraP01849 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
TcraP01849 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
TcraP01849 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
TcraP01849 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
TcraP01849 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,04■□□□□ 0,8
TcraP01849 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
TcraP01849 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
TcraP01849 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
TcraP01849 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
TcraP01849 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
TcraP01849 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
TcraP01849 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,96■□□□□ 0,79
TcraP01849 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
TcraP01849 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
TcraP01849 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
TcraP01849 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
TcraP01849 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
TcraP01849 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
TcraP01849 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
TcraP01849 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
TcraP01849 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
TcraP01849 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
TcraP01849 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,76■□□□□ 0,75
TcraP01849 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
TcraP01849 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,74■□□□□ 0,75
TcraP01849 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
TcraP01849 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
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