RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	RRN5	Q02983	363 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	CDC9	P04819	755 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	TOP3	P13099	656 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PET123	P17558	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MRPL25	P23369	157 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	GRR1	P24814	1151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
RFU1	YLR073C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	DAL3	P32459	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	UTR2	P32623	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	RER2	P35196	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MRPL7	P36519	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YBR284W	P38150	797 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	HSM3	P38348	480 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YHL026C	P38740	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	DYS1	P38791	387 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	GCD10	P41814	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ZIM17	P42844	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	AGX1	P43567	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	NUP84	P52891	726 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	NNF2	P53253	936 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	JJJ1	P53863	590 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	TEP1	P53916	434 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PEX19	Q07418	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	DSE3	Q08729	430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	NFI1	Q12216	726 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	IRA1	P18963	3092 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	CKA1	P15790	372 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	KAR3	P17119	729 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	VMA3	P25515	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	POL4	P25615	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	CSE2	P33308	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ATG19	P35193	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MRPL16	P38064	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SAF1	P38352	637 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SUL1	P38359	859 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	TDA3	P38758	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	UME6	P39001	836 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SAW1	P39735	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	STL1	P39932	569 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ZAP1	P47043	880 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	GNP1	P48813	663 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MDR1	P53258	950 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	CBK1	P53894	756 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	EOS1	P53938	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SIW14	P53965	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YML053C	Q04978	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ARP9	Q05123	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MCP2	Q06567	569 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	HDA2	Q06629	674 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	CRD1	Q07560	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PCD1	Q12524	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	CDC16	P09798	840 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	GPI10	P30777	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PUP2	P32379	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MIC60	P36112	540 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PET10	P36139	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MTG2	P38860	518 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YHR202W	P38887	602 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MBP1	P39678	833 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	GYP8	P43570	497 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	BNA2	P47125	453 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ASK10	P48361	1146 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ALT2	P52892	507 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ORC4	P54791	529 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	YML119W	Q03208	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	TFC6	Q06339	672 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	PHO92	Q06390	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	VHS3	Q08438	674 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	WTM2	Q12206	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	ARP7	Q12406	477 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFU1	YLR073C	SEC39	Q12745	709 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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