RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	not detected
SYF1	YDR416W	YCK1	P23291	538 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RSC6	P25632	483 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MRP20	P32387	263 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SPT8	P38915	602 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SMF1	P38925	575 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	LAM5	P43560	674 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	AGX1	P43567	385 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	NGL3	Q03210	505 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PLP2	Q12017	286 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	COX17	Q12287	69 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PSY3	Q12318	242 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CBS1	P14066	229 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	HNM1	P19807	563 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PEP3	P27801	918 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MTG2	P38860	518 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	VPS45	P38932	577 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	OSW5	P40219	148 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ATF1	P40353	525 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YFL054C	P43549	646 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	FET5	P43561	622 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	HFM1	P51979	1187 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RCO1	Q04779	684 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CRD1	Q07560	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MDY2	Q12285	212 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PRC1	P00729	532 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RPC82	P32349	654 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	LOT5	P34234	306 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CAB3	P36076	571 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PCH2	P38126	564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MEF2	P39677	819 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YEL057C	P39983	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MET18	P40469	1032 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	EFM4	P40516	257 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CEP3	P40969	608 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CUL3	P53202	744 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RRN5	Q02983	363 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RBA50	Q04418	439 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YPS7	Q06325	596 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ENT4	Q07872	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YLR302C	O13544	120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PCK1	P10963	549 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	KAR3	P17119	729 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CLB3	P24870	427 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YEL043W	P32618	956 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	DAD2	P36162	133 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SRO77	P38163	1010 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YBL029W	P38201	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	POA1	P38218	177 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MSC7	P38694	644 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	NUP84	P52891	726 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	TEL2	P53038	688 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	GPM3	Q12326	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	VPS17	P32913	551 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	SUR1	P33300	382 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	KEL2	P50090	882 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RPN14	P53196	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	VTC3	Q02725	835 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RAD30	Q04049	632 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	STP4	Q07351	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CPR2	P23285	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	HEL1	P36113	551 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	RRT14	P40470	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	TCB2	P48231	1178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	PEF1	P53238	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ORC4	P54791	529 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ACS1	Q01574	713 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	ARV1	Q06541	321 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	CWH43	P25618	953 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	YCR051W	P25631	222 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MSP1	P28737	362 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	LRG1	P35688	1017 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	UBP13	P38187	747 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SYF1	YDR416W	MRX1	P40050	688 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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