RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ubtd1Q91WB7 227 aa9.9□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa9.9□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm21370Q3T9V6 190 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 AdipoqQ60994 247 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gnb1lQ9EQ15 326 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Csn3P06796 181 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ripply2Q2WG76 128 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm7489Q3UT34 171 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fmc1Q9CR13 113 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Reg1P43137 165 aa9.89□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm12057A0A087WR21 115 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem262D3Z338 116 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm6871L7N248 545 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm4763Q8CFJ5 196 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Znhit3Q9CQK1 151 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc25a16Q8C0K5 332 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wfdc2Q9DAU7 174 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wnk1P83741 2377 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm28269A0A087WSG3 125 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sap30O88574 220 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam110aQ8R184 296 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dusp14Q9JLY7 198 aa9.88□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Omt2bD3YX29 119 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 SbpP15501 199 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm12689Q8BQU9 117 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prss41Q920S2 322 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rab1bQ9D1G1 201 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cend1Q9JKC6 149 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tomm6Q9CQN3 74 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tpsg1Q9QUL7 311 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ighv1-55A0A075B5W6 117 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm28778A0A087WSK7 233 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd5P13379 494 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PpdpfQ9CR37 115 aa9.87□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 P0C1Z5 52 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 1700067P10RikG3X8U2 183 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rnf5O35445 180 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hoxb4P10284 250 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ighv3-6P18531 116 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Shisal2aA2A9G7 189 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tcf15Q60756 195 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rchy1Q9CR50 261 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Q9DAZ5 108 aa9.86□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ighv5-6A0A075B5Q0 117 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 H2al2bA9Z055 111 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 P01649 108 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Spock3Q8BKV0 436 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CrxO54751 299 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rps20P60867 119 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Spsb3Q571F5 354 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CrygcQ61597 174 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Klk7Q91VE3 249 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Brwd1Q921C3 2304 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Igsf23B2RTN2 239 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 NgfP01139 241 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 P01723 117 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dlx6P70397 175 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm10604Q3V0X7 143 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 MycbQ6P8Z1 170 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Snrnp40Q6PE01 358 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem219Q9D123 240 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Q9D131 166 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cysrt1Q9D1E4 142 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam241bQ9D882 120 aa9.85□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Trav7n-5A0A075B604 112 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Itgb1bp1O35671 200 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gata3P23772 443 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 NrepQ07475 68 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 OtosQ8R448 89 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gkn1Q9CR36 201 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 AY761184Q9D848 116 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp119aQ9JIC0 545 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bak1O08734 209 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dmrtc2Q8CGW9 370 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wipf1Q8K1I7 493 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr975Q8VG91 310 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rab9aQ9R0M6 201 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Col4a4Q9QZR9 1682 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr904Q7TRC9 310 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lyrm7Q9DA03 104 aa9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ovol1Q9WTJ2 267 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ighv1-37A0A0A6YW32 117 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ighv1-31A0A0A6YWK5 117 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rtl10D3YWW5 146 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Q5BN45 167 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr322Q5NCC8 327 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr317Q5NCD6 327 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ttc9cQ810A3 171 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 IcosQ9WVS0 200 aa9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ly6lH3BJG9 140 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.2 ms