Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W6

Ighv1-55, Immunoglobulin heavy variable 1-55 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ighv1-55A0A075B5W6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ighv1-55A0A075B5W6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ighv1-55A0A075B5W6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ighv1-55A0A075B5W6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ighv1-55A0A075B5W6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ighv1-55A0A075B5W6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighv1-55A0A075B5W6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ighv1-55A0A075B5W6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ighv1-55A0A075B5W6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ighv1-55A0A075B5W6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ighv1-55A0A075B5W6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighv1-55A0A075B5W6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighv1-55A0A075B5W6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighv1-55A0A075B5W6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ighv1-55A0A075B5W6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighv1-55A0A075B5W6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ighv1-55A0A075B5W6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighv1-55A0A075B5W6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ighv1-55A0A075B5W6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighv1-55A0A075B5W6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighv1-55A0A075B5W6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ighv1-55A0A075B5W6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighv1-55A0A075B5W6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ighv1-55A0A075B5W6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighv1-55A0A075B5W6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighv1-55A0A075B5W6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv1-55A0A075B5W6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighv1-55A0A075B5W6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighv1-55A0A075B5W6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighv1-55A0A075B5W6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighv1-55A0A075B5W6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighv1-55A0A075B5W6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv1-55A0A075B5W6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighv1-55A0A075B5W6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv1-55A0A075B5W6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighv1-55A0A075B5W6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighv1-55A0A075B5W6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighv1-55A0A075B5W6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighv1-55A0A075B5W6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv1-55A0A075B5W6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv1-55A0A075B5W6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ighv1-55A0A075B5W6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv1-55A0A075B5W6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv1-55A0A075B5W6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighv1-55A0A075B5W6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv1-55A0A075B5W6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighv1-55A0A075B5W6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv1-55A0A075B5W6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv1-55A0A075B5W6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv1-55A0A075B5W6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv1-55A0A075B5W6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighv1-55A0A075B5W6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv1-55A0A075B5W6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ighv1-55A0A075B5W6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-55A0A075B5W6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv1-55A0A075B5W6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv1-55A0A075B5W6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv1-55A0A075B5W6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighv1-55A0A075B5W6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-55A0A075B5W6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ighv1-55A0A075B5W6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-55A0A075B5W6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv1-55A0A075B5W6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-55A0A075B5W6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv1-55A0A075B5W6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv1-55A0A075B5W6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ighv1-55A0A075B5W6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighv1-55A0A075B5W6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighv1-55A0A075B5W6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv1-55A0A075B5W6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv1-55A0A075B5W6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-55A0A075B5W6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv1-55A0A075B5W6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv1-55A0A075B5W6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-55A0A075B5W6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-55A0A075B5W6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-55A0A075B5W6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-55A0A075B5W6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighv1-55A0A075B5W6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv1-55A0A075B5W6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv1-55A0A075B5W6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms