Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Hoxb4P10284 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Hoxb4P10284 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hoxb4P10284 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Hoxb4P10284 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Hoxb4P10284 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxb4P10284 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxb4P10284 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxb4P10284 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxb4P10284 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Hoxb4P10284 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Hoxb4P10284 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hoxb4P10284 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Hoxb4P10284 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Hoxb4P10284 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Hoxb4P10284 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hoxb4P10284 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hoxb4P10284 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxb4P10284 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxb4P10284 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxb4P10284 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxb4P10284 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxb4P10284 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxb4P10284 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxb4P10284 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxb4P10284 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxb4P10284 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxb4P10284 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxb4P10284 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxb4P10284 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxb4P10284 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxb4P10284 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxb4P10284 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxb4P10284 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxb4P10284 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hoxb4P10284 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxb4P10284 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb4P10284 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxb4P10284 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxb4P10284 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxb4P10284 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxb4P10284 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxb4P10284 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxb4P10284 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxb4P10284 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxb4P10284 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb4P10284 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxb4P10284 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxb4P10284 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxb4P10284 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb4P10284 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb4P10284 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxb4P10284 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxb4P10284 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxb4P10284 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxb4P10284 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxb4P10284 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxb4P10284 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxb4P10284 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxb4P10284 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxb4P10284 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxb4P10284 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxb4P10284 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxb4P10284 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxb4P10284 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb4P10284 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxb4P10284 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxb4P10284 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxb4P10284 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxb4P10284 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb4P10284 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxb4P10284 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxb4P10284 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxb4P10284 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxb4P10284 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb4P10284 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb4P10284 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb4P10284 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb4P10284 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb4P10284 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb4P10284 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb4P10284 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb4P10284 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb4P10284 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb4P10284 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb4P10284 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb4P10284 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxb4P10284 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb4P10284 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb4P10284 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxb4P10284 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hoxb4P10284 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb4P10284 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb4P10284 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb4P10284 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb4P10284 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb4P10284 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxb4P10284 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb4P10284 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb4P10284 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms