Protein–RNA interactions for Protein: P01723

Ig lambda-1 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01723 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,78■■■□□ 2,84
P01723 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
P01723 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
P01723 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
P01723 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
P01723 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
P01723 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
P01723 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
P01723 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
P01723 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
P01723 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
P01723 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
P01723 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
P01723 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
P01723 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
P01723 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
P01723 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
P01723 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
P01723 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
P01723 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
P01723 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,28■■□□□ 1,8
P01723 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
P01723 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
P01723 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
P01723 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
P01723 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
P01723 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
P01723 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
P01723 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
P01723 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
P01723 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
P01723 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,89■■□□□ 1,73
P01723 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
P01723 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
P01723 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
P01723 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
P01723 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
P01723 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
P01723 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,42■■□□□ 1,66
P01723 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
P01723 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
P01723 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
P01723 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
P01723 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
P01723 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
P01723 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
P01723 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
P01723 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
P01723 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
P01723 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
P01723 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
P01723 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
P01723 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
P01723 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
P01723 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
P01723 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
P01723 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
P01723 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
P01723 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
P01723 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
P01723 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
P01723 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
P01723 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
P01723 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
P01723 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
P01723 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
P01723 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
P01723 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
P01723 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
P01723 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
P01723 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
P01723 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,34■■□□□ 1,49
P01723 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
P01723 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
P01723 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
P01723 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
P01723 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
P01723 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
P01723 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
P01723 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
P01723 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
P01723 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,25■■□□□ 1,47
P01723 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
P01723 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
P01723 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
P01723 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
P01723 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
P01723 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
P01723 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
P01723 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
P01723 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01723 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01723 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
P01723 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,05■■□□□ 1,44
P01723 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
P01723 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
P01723 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
P01723 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,97■■□□□ 1,43
P01723 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
P01723 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms