Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Gata3P23772 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gata3P23772 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gata3P23772 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gata3P23772 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gata3P23772 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gata3P23772 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gata3P23772 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gata3P23772 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gata3P23772 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gata3P23772 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gata3P23772 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gata3P23772 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gata3P23772 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata3P23772 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gata3P23772 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gata3P23772 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gata3P23772 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gata3P23772 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata3P23772 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gata3P23772 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata3P23772 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata3P23772 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gata3P23772 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gata3P23772 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gata3P23772 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gata3P23772 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gata3P23772 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata3P23772 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gata3P23772 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata3P23772 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata3P23772 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata3P23772 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata3P23772 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gata3P23772 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gata3P23772 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gata3P23772 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gata3P23772 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gata3P23772 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gata3P23772 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gata3P23772 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gata3P23772 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gata3P23772 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gata3P23772 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gata3P23772 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gata3P23772 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gata3P23772 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gata3P23772 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gata3P23772 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gata3P23772 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gata3P23772 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gata3P23772 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gata3P23772 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gata3P23772 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata3P23772 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata3P23772 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gata3P23772 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gata3P23772 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gata3P23772 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gata3P23772 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gata3P23772 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gata3P23772 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gata3P23772 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gata3P23772 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gata3P23772 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gata3P23772 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gata3P23772 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gata3P23772 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata3P23772 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata3P23772 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata3P23772 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata3P23772 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata3P23772 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata3P23772 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata3P23772 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata3P23772 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata3P23772 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata3P23772 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata3P23772 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata3P23772 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gata3P23772 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata3P23772 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata3P23772 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata3P23772 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata3P23772 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata3P23772 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gata3P23772 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gata3P23772 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gata3P23772 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gata3P23772 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gata3P23772 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gata3P23772 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gata3P23772 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gata3P23772 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata3P23772 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gata3P23772 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gata3P23772 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gata3P23772 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gata3P23772 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gata3P23772 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms