Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Gata3P23772 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Gata3P23772 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gata3P23772 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Gata3P23772 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Gata3P23772 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gata3P23772 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gata3P23772 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Gata3P23772 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Gata3P23772 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Gata3P23772 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Gata3P23772 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
Gata3P23772 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Gata3P23772 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Gata3P23772 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Gata3P23772 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gata3P23772 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Gata3P23772 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Gata3P23772 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Gata3P23772 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Gata3P23772 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Gata3P23772 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Gata3P23772 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gata3P23772 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Gata3P23772 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Gata3P23772 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Gata3P23772 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gata3P23772 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Gata3P23772 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Gata3P23772 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Gata3P23772 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Gata3P23772 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Gata3P23772 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Gata3P23772 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Gata3P23772 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Gata3P23772 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Gata3P23772 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Gata3P23772 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,44■■□□□ 1,18
Gata3P23772 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Gata3P23772 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Gata3P23772 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Gata3P23772 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Gata3P23772 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Gata3P23772 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Gata3P23772 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gata3P23772 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Gata3P23772 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Gata3P23772 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gata3P23772 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
Gata3P23772 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gata3P23772 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gata3P23772 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,16■■□□□ 1,14
Gata3P23772 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Gata3P23772 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Gata3P23772 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Gata3P23772 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Gata3P23772 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Gata3P23772 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
Gata3P23772 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Gata3P23772 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Gata3P23772 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Gata3P23772 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Gata3P23772 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Gata3P23772 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Gata3P23772 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Gata3P23772 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Gata3P23772 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Gata3P23772 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Gata3P23772 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Gata3P23772 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Gata3P23772 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Gata3P23772 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Gata3P23772 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Gata3P23772 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Gata3P23772 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Gata3P23772 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Gata3P23772 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,46■■□□□ 1,03
Gata3P23772 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Gata3P23772 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Gata3P23772 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Gata3P23772 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Gata3P23772 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Gata3P23772 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Gata3P23772 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Gata3P23772 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Gata3P23772 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Gata3P23772 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Gata3P23772 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Gata3P23772 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Gata3P23772 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Gata3P23772 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Gata3P23772 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Gata3P23772 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Gata3P23772 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Gata3P23772 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Gata3P23772 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Gata3P23772 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Gata3P23772 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Gata3P23772 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Gata3P23772 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21,08■□□□□ 0,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms