Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Rab1bQ9D1G1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rab1bQ9D1G1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rab1bQ9D1G1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rab1bQ9D1G1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab1bQ9D1G1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab1bQ9D1G1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab1bQ9D1G1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab1bQ9D1G1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab1bQ9D1G1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab1bQ9D1G1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab1bQ9D1G1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab1bQ9D1G1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab1bQ9D1G1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab1bQ9D1G1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab1bQ9D1G1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab1bQ9D1G1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab1bQ9D1G1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab1bQ9D1G1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab1bQ9D1G1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab1bQ9D1G1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab1bQ9D1G1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab1bQ9D1G1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab1bQ9D1G1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab1bQ9D1G1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab1bQ9D1G1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab1bQ9D1G1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab1bQ9D1G1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab1bQ9D1G1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab1bQ9D1G1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab1bQ9D1G1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab1bQ9D1G1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab1bQ9D1G1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab1bQ9D1G1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab1bQ9D1G1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab1bQ9D1G1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab1bQ9D1G1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab1bQ9D1G1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab1bQ9D1G1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab1bQ9D1G1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab1bQ9D1G1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab1bQ9D1G1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab1bQ9D1G1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab1bQ9D1G1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab1bQ9D1G1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab1bQ9D1G1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab1bQ9D1G1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab1bQ9D1G1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab1bQ9D1G1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab1bQ9D1G1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab1bQ9D1G1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab1bQ9D1G1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab1bQ9D1G1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab1bQ9D1G1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab1bQ9D1G1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab1bQ9D1G1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab1bQ9D1G1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab1bQ9D1G1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab1bQ9D1G1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab1bQ9D1G1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab1bQ9D1G1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab1bQ9D1G1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab1bQ9D1G1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab1bQ9D1G1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab1bQ9D1G1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rab1bQ9D1G1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab1bQ9D1G1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab1bQ9D1G1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab1bQ9D1G1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab1bQ9D1G1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab1bQ9D1G1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab1bQ9D1G1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab1bQ9D1G1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab1bQ9D1G1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab1bQ9D1G1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab1bQ9D1G1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab1bQ9D1G1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab1bQ9D1G1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab1bQ9D1G1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab1bQ9D1G1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab1bQ9D1G1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab1bQ9D1G1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab1bQ9D1G1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab1bQ9D1G1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab1bQ9D1G1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab1bQ9D1G1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab1bQ9D1G1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab1bQ9D1G1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab1bQ9D1G1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab1bQ9D1G1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab1bQ9D1G1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab1bQ9D1G1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab1bQ9D1G1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms