Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Shisal2aA2A9G7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Shisal2aA2A9G7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shisal2aA2A9G7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Shisal2aA2A9G7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Shisal2aA2A9G7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shisal2aA2A9G7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shisal2aA2A9G7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shisal2aA2A9G7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shisal2aA2A9G7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Shisal2aA2A9G7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shisal2aA2A9G7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shisal2aA2A9G7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shisal2aA2A9G7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Shisal2aA2A9G7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shisal2aA2A9G7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shisal2aA2A9G7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Shisal2aA2A9G7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shisal2aA2A9G7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shisal2aA2A9G7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shisal2aA2A9G7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shisal2aA2A9G7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shisal2aA2A9G7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shisal2aA2A9G7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shisal2aA2A9G7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Shisal2aA2A9G7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shisal2aA2A9G7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shisal2aA2A9G7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shisal2aA2A9G7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shisal2aA2A9G7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Shisal2aA2A9G7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shisal2aA2A9G7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shisal2aA2A9G7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shisal2aA2A9G7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shisal2aA2A9G7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shisal2aA2A9G7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shisal2aA2A9G7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shisal2aA2A9G7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shisal2aA2A9G7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Shisal2aA2A9G7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shisal2aA2A9G7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shisal2aA2A9G7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shisal2aA2A9G7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Shisal2aA2A9G7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shisal2aA2A9G7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shisal2aA2A9G7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shisal2aA2A9G7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shisal2aA2A9G7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shisal2aA2A9G7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisal2aA2A9G7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shisal2aA2A9G7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Shisal2aA2A9G7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shisal2aA2A9G7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shisal2aA2A9G7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shisal2aA2A9G7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shisal2aA2A9G7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shisal2aA2A9G7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shisal2aA2A9G7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Shisal2aA2A9G7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shisal2aA2A9G7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shisal2aA2A9G7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shisal2aA2A9G7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shisal2aA2A9G7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shisal2aA2A9G7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shisal2aA2A9G7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shisal2aA2A9G7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shisal2aA2A9G7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shisal2aA2A9G7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shisal2aA2A9G7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shisal2aA2A9G7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shisal2aA2A9G7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisal2aA2A9G7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisal2aA2A9G7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shisal2aA2A9G7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shisal2aA2A9G7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shisal2aA2A9G7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shisal2aA2A9G7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shisal2aA2A9G7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shisal2aA2A9G7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shisal2aA2A9G7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shisal2aA2A9G7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shisal2aA2A9G7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shisal2aA2A9G7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shisal2aA2A9G7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shisal2aA2A9G7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shisal2aA2A9G7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shisal2aA2A9G7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shisal2aA2A9G7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shisal2aA2A9G7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shisal2aA2A9G7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shisal2aA2A9G7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shisal2aA2A9G7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shisal2aA2A9G7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shisal2aA2A9G7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Shisal2aA2A9G7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Shisal2aA2A9G7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Shisal2aA2A9G7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shisal2aA2A9G7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Shisal2aA2A9G7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms