Protein–RNA interactions for Protein: P43137

Reg1, Lithostathine-1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg1P43137 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Reg1P43137 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Reg1P43137 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Reg1P43137 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Reg1P43137 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Reg1P43137 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Reg1P43137 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Reg1P43137 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Reg1P43137 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Reg1P43137 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Reg1P43137 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Reg1P43137 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Reg1P43137 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Reg1P43137 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Reg1P43137 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Reg1P43137 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Reg1P43137 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Reg1P43137 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Reg1P43137 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Reg1P43137 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Reg1P43137 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Reg1P43137 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Reg1P43137 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Reg1P43137 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Reg1P43137 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Reg1P43137 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Reg1P43137 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Reg1P43137 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Reg1P43137 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Reg1P43137 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Reg1P43137 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Reg1P43137 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Reg1P43137 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Reg1P43137 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Reg1P43137 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Reg1P43137 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Reg1P43137 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Reg1P43137 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Reg1P43137 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Reg1P43137 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Reg1P43137 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Reg1P43137 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Reg1P43137 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Reg1P43137 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Reg1P43137 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Reg1P43137 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Reg1P43137 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Reg1P43137 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Reg1P43137 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Reg1P43137 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Reg1P43137 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Reg1P43137 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Reg1P43137 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Reg1P43137 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Reg1P43137 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Reg1P43137 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Reg1P43137 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Reg1P43137 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Reg1P43137 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Reg1P43137 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Reg1P43137 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Reg1P43137 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Reg1P43137 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Reg1P43137 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Reg1P43137 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Reg1P43137 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Reg1P43137 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Reg1P43137 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Reg1P43137 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Reg1P43137 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Reg1P43137 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Reg1P43137 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Reg1P43137 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reg1P43137 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Reg1P43137 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Reg1P43137 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Reg1P43137 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Reg1P43137 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Reg1P43137 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Reg1P43137 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Reg1P43137 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Reg1P43137 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Reg1P43137 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Reg1P43137 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Reg1P43137 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Reg1P43137 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Reg1P43137 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Reg1P43137 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Reg1P43137 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Reg1P43137 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Reg1P43137 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Reg1P43137 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Reg1P43137 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Reg1P43137 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reg1P43137 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reg1P43137 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Reg1P43137 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Reg1P43137 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Reg1P43137 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Reg1P43137 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms