Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
AY761184Q9D848 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
AY761184Q9D848 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AY761184Q9D848 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
AY761184Q9D848 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AY761184Q9D848 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AY761184Q9D848 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AY761184Q9D848 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AY761184Q9D848 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AY761184Q9D848 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AY761184Q9D848 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
AY761184Q9D848 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AY761184Q9D848 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AY761184Q9D848 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AY761184Q9D848 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AY761184Q9D848 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AY761184Q9D848 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AY761184Q9D848 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AY761184Q9D848 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AY761184Q9D848 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AY761184Q9D848 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AY761184Q9D848 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AY761184Q9D848 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AY761184Q9D848 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AY761184Q9D848 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AY761184Q9D848 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AY761184Q9D848 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AY761184Q9D848 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AY761184Q9D848 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AY761184Q9D848 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
AY761184Q9D848 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AY761184Q9D848 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AY761184Q9D848 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AY761184Q9D848 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AY761184Q9D848 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AY761184Q9D848 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AY761184Q9D848 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AY761184Q9D848 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AY761184Q9D848 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AY761184Q9D848 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AY761184Q9D848 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AY761184Q9D848 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AY761184Q9D848 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AY761184Q9D848 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AY761184Q9D848 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AY761184Q9D848 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AY761184Q9D848 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AY761184Q9D848 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AY761184Q9D848 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AY761184Q9D848 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AY761184Q9D848 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AY761184Q9D848 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AY761184Q9D848 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AY761184Q9D848 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AY761184Q9D848 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AY761184Q9D848 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AY761184Q9D848 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AY761184Q9D848 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AY761184Q9D848 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AY761184Q9D848 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AY761184Q9D848 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AY761184Q9D848 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AY761184Q9D848 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AY761184Q9D848 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AY761184Q9D848 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AY761184Q9D848 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AY761184Q9D848 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AY761184Q9D848 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AY761184Q9D848 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AY761184Q9D848 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AY761184Q9D848 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AY761184Q9D848 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AY761184Q9D848 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AY761184Q9D848 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AY761184Q9D848 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AY761184Q9D848 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AY761184Q9D848 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AY761184Q9D848 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AY761184Q9D848 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AY761184Q9D848 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AY761184Q9D848 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AY761184Q9D848 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AY761184Q9D848 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AY761184Q9D848 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AY761184Q9D848 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AY761184Q9D848 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AY761184Q9D848 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AY761184Q9D848 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AY761184Q9D848 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AY761184Q9D848 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AY761184Q9D848 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AY761184Q9D848 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AY761184Q9D848 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AY761184Q9D848 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AY761184Q9D848 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AY761184Q9D848 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AY761184Q9D848 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AY761184Q9D848 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AY761184Q9D848 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AY761184Q9D848 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms