Protein–RNA interactions for Protein: Q61597

Crygc, Gamma-crystallin C, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygcQ61597 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
CrygcQ61597 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
CrygcQ61597 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
CrygcQ61597 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
CrygcQ61597 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
CrygcQ61597 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
CrygcQ61597 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
CrygcQ61597 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
CrygcQ61597 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
CrygcQ61597 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
CrygcQ61597 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
CrygcQ61597 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
CrygcQ61597 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
CrygcQ61597 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
CrygcQ61597 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
CrygcQ61597 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
CrygcQ61597 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
CrygcQ61597 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
CrygcQ61597 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
CrygcQ61597 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
CrygcQ61597 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
CrygcQ61597 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
CrygcQ61597 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
CrygcQ61597 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
CrygcQ61597 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
CrygcQ61597 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
CrygcQ61597 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
CrygcQ61597 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
CrygcQ61597 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
CrygcQ61597 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,06■■□□□ 1,44
CrygcQ61597 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
CrygcQ61597 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
CrygcQ61597 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
CrygcQ61597 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
CrygcQ61597 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
CrygcQ61597 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
CrygcQ61597 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
CrygcQ61597 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
CrygcQ61597 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
CrygcQ61597 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,68■■□□□ 1,38
CrygcQ61597 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
CrygcQ61597 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
CrygcQ61597 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
CrygcQ61597 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
CrygcQ61597 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
CrygcQ61597 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
CrygcQ61597 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
CrygcQ61597 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
CrygcQ61597 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,29■■□□□ 1,32
CrygcQ61597 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
CrygcQ61597 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
CrygcQ61597 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
CrygcQ61597 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
CrygcQ61597 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
CrygcQ61597 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
CrygcQ61597 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
CrygcQ61597 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
CrygcQ61597 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
CrygcQ61597 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
CrygcQ61597 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
CrygcQ61597 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
CrygcQ61597 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
CrygcQ61597 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
CrygcQ61597 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
CrygcQ61597 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
CrygcQ61597 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,75■■□□□ 1,23
CrygcQ61597 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
CrygcQ61597 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
CrygcQ61597 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
CrygcQ61597 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
CrygcQ61597 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
CrygcQ61597 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
CrygcQ61597 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
CrygcQ61597 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
CrygcQ61597 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
CrygcQ61597 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
CrygcQ61597 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
CrygcQ61597 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
CrygcQ61597 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,38■■□□□ 1,17
CrygcQ61597 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
CrygcQ61597 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
CrygcQ61597 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
CrygcQ61597 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
CrygcQ61597 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
CrygcQ61597 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,3■■□□□ 1,16
CrygcQ61597 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
CrygcQ61597 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
CrygcQ61597 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
CrygcQ61597 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
CrygcQ61597 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
CrygcQ61597 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
CrygcQ61597 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
CrygcQ61597 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
CrygcQ61597 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
CrygcQ61597 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
CrygcQ61597 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
CrygcQ61597 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
CrygcQ61597 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
CrygcQ61597 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
CrygcQ61597 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,08■■□□□ 1,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,2 ms