RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 Med13Q5SWW4 2171 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm12355A2A4X6 163 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm2174F6ZVF2 133 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 TcraP01849 138 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Srsf3P84104 164 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Leap2Q91V13 76 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Spata45Q9CVW4 97 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Atp23Q9CWQ3 201 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zc2hc1bQ9D534 172 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 GrnP28798 589 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ang6Q5GAN0 147 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm28038F7BCN9 126 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ly86O88188 162 aa9.7□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dnase2P56542 353 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm20854Q62461 227 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fgf16Q9ESL8 207 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cd5lQ9QWK4 352 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 C1ql4Q4ZJM9 238 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Bud31Q6PGH1 103 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Iba57Q8CAK1 358 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Crybb3Q9JJU9 211 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-36A0A0A6YXT2 117 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trbv13-3A0A0B4J1H2 113 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 MturnQ8CGA4 131 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Clec5aQ9R007 190 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav7n-4A0A075B620 113 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Wdr90Q6ZPG2 1874 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Klf11Q8K1S5 502 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pgpep1Q9ESW8 209 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pmaip1Q9JM54 103 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Olfr779E9PUS9 130 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01649 108 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cela2aP05208 271 aa9.69□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Olfr477Q8VGI6 310 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mrpl27Q99N92 148 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ms4a12A0A087WSB9 263 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zfp950A0A0U1RQ46 609 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv6-15A0A140T8M5 115 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01680 129 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 LoxP28301 411 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 PlnP61014 52 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 HilpdaQ9JLS0 64 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sec16aA2AIX1 2377 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zfp27P10077 819 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fxyd7P59648 80 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Supt4h1aP63271 117 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 C1qtnf9Q4ZJN1 333 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 MycbQ6P8Z1 170 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ube2e2Q91W82 201 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 TtrP07309 147 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm94Q3V2D2 93 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znf474Q6V5K9 347 aa9.68□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mmp23O88676 391 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ube2e1P52482 193 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fhl4Q8CDC8 279 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Olfr498Q8VEW2 330 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm37388A0A0A6YY46 143 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Klf12O35738 402 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm1553Q66VB7 94 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav9-1A0A075B601 112 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm13030A2APQ6 143 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv1-99F6XWB2 120 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Psg25Q497W1 475 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ttc9cQ810A3 171 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm5148Q8BGG2 154 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-69A0A0G2JFS5 117 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 5930422O12RikQ8C4Y4 123 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ifi27l2aQ8R412 90 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gpx7Q99LJ6 186 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sptbn1Q62261 2363 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Exph5Q0VAV2 1960 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Iglc2P01844 104 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Q8R092 253 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pygo1Q9D0P5 417 aa9.67□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm5868Q8BJG1 145 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Crlf1Q9JM58 425 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 V1ra8Q9EQ48 279 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Col6a6Q8C6K9 2265 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tex54G3UW99 86 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defa4P28311 92 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 LgalslbQ7TPX9 165 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hint1P70349 126 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znf329Q6GQR8 522 aa9.66□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa9.65□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem170aQ9D342 144 aa9.65□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Heatr1G3X9B1 2143 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa9.65□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv19-93A0A0G2JFZ3 115 aa9.65□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 F11rO88792 300 aa9.65□□□□□ -0.86
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem241Q3UME2 297 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.1 ms