Protein–RNA interactions for Protein: P01844

Iglc2, Ig lambda-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iglc2P01844 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Iglc2P01844 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Iglc2P01844 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Iglc2P01844 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Iglc2P01844 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Iglc2P01844 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Iglc2P01844 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Iglc2P01844 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Iglc2P01844 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Iglc2P01844 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Iglc2P01844 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iglc2P01844 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Iglc2P01844 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iglc2P01844 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Iglc2P01844 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Iglc2P01844 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Iglc2P01844 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iglc2P01844 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Iglc2P01844 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iglc2P01844 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Iglc2P01844 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Iglc2P01844 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Iglc2P01844 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Iglc2P01844 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Iglc2P01844 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Iglc2P01844 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Iglc2P01844 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Iglc2P01844 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Iglc2P01844 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Iglc2P01844 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Iglc2P01844 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Iglc2P01844 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Iglc2P01844 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Iglc2P01844 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Iglc2P01844 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Iglc2P01844 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Iglc2P01844 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Iglc2P01844 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Iglc2P01844 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Iglc2P01844 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Iglc2P01844 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Iglc2P01844 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Iglc2P01844 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Iglc2P01844 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Iglc2P01844 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Iglc2P01844 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Iglc2P01844 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Iglc2P01844 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Iglc2P01844 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Iglc2P01844 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Iglc2P01844 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Iglc2P01844 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Iglc2P01844 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iglc2P01844 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Iglc2P01844 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iglc2P01844 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iglc2P01844 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iglc2P01844 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iglc2P01844 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iglc2P01844 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Iglc2P01844 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Iglc2P01844 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Iglc2P01844 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Iglc2P01844 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Iglc2P01844 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Iglc2P01844 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Iglc2P01844 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Iglc2P01844 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Iglc2P01844 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Iglc2P01844 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Iglc2P01844 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Iglc2P01844 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Iglc2P01844 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Iglc2P01844 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Iglc2P01844 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Iglc2P01844 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Iglc2P01844 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Iglc2P01844 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Iglc2P01844 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Iglc2P01844 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Iglc2P01844 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Iglc2P01844 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Iglc2P01844 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iglc2P01844 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Iglc2P01844 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Iglc2P01844 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Iglc2P01844 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Iglc2P01844 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Iglc2P01844 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Iglc2P01844 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Iglc2P01844 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Iglc2P01844 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Iglc2P01844 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Iglc2P01844 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Iglc2P01844 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Iglc2P01844 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Iglc2P01844 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Iglc2P01844 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Iglc2P01844 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Iglc2P01844 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms