Protein–RNA interactions for Protein: Q9D342

Tmem170a, Transmembrane protein 170A, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170aQ9D342 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem170aQ9D342 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem170aQ9D342 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem170aQ9D342 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem170aQ9D342 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem170aQ9D342 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem170aQ9D342 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem170aQ9D342 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem170aQ9D342 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem170aQ9D342 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem170aQ9D342 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem170aQ9D342 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem170aQ9D342 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem170aQ9D342 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem170aQ9D342 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem170aQ9D342 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem170aQ9D342 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem170aQ9D342 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem170aQ9D342 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem170aQ9D342 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem170aQ9D342 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem170aQ9D342 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem170aQ9D342 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem170aQ9D342 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem170aQ9D342 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem170aQ9D342 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem170aQ9D342 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem170aQ9D342 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem170aQ9D342 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem170aQ9D342 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem170aQ9D342 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem170aQ9D342 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem170aQ9D342 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem170aQ9D342 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem170aQ9D342 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem170aQ9D342 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem170aQ9D342 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem170aQ9D342 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmem170aQ9D342 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem170aQ9D342 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem170aQ9D342 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem170aQ9D342 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem170aQ9D342 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem170aQ9D342 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem170aQ9D342 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem170aQ9D342 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem170aQ9D342 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem170aQ9D342 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem170aQ9D342 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem170aQ9D342 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem170aQ9D342 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem170aQ9D342 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem170aQ9D342 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem170aQ9D342 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem170aQ9D342 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem170aQ9D342 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem170aQ9D342 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem170aQ9D342 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem170aQ9D342 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem170aQ9D342 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem170aQ9D342 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem170aQ9D342 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem170aQ9D342 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem170aQ9D342 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem170aQ9D342 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem170aQ9D342 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem170aQ9D342 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem170aQ9D342 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem170aQ9D342 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem170aQ9D342 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem170aQ9D342 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem170aQ9D342 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem170aQ9D342 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem170aQ9D342 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem170aQ9D342 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem170aQ9D342 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem170aQ9D342 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem170aQ9D342 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem170aQ9D342 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem170aQ9D342 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem170aQ9D342 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem170aQ9D342 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem170aQ9D342 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem170aQ9D342 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem170aQ9D342 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem170aQ9D342 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem170aQ9D342 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem170aQ9D342 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem170aQ9D342 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem170aQ9D342 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem170aQ9D342 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem170aQ9D342 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem170aQ9D342 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem170aQ9D342 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem170aQ9D342 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem170aQ9D342 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem170aQ9D342 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem170aQ9D342 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem170aQ9D342 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem170aQ9D342 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1892.1 ms