Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trbv13-3A0A0B4J1H2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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