Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Trbv13-3A0A0B4J1H2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23■■□□□ 1,27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trbv13-3A0A0B4J1H2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Trbv13-3A0A0B4J1H2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms