Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pgpep1Q9ESW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pgpep1Q9ESW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pgpep1Q9ESW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pgpep1Q9ESW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pgpep1Q9ESW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgpep1Q9ESW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgpep1Q9ESW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgpep1Q9ESW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgpep1Q9ESW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pgpep1Q9ESW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pgpep1Q9ESW8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgpep1Q9ESW8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pgpep1Q9ESW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pgpep1Q9ESW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pgpep1Q9ESW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pgpep1Q9ESW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgpep1Q9ESW8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgpep1Q9ESW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgpep1Q9ESW8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgpep1Q9ESW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pgpep1Q9ESW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pgpep1Q9ESW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pgpep1Q9ESW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pgpep1Q9ESW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pgpep1Q9ESW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pgpep1Q9ESW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pgpep1Q9ESW8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pgpep1Q9ESW8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pgpep1Q9ESW8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pgpep1Q9ESW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pgpep1Q9ESW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pgpep1Q9ESW8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pgpep1Q9ESW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pgpep1Q9ESW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pgpep1Q9ESW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pgpep1Q9ESW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pgpep1Q9ESW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pgpep1Q9ESW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pgpep1Q9ESW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pgpep1Q9ESW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pgpep1Q9ESW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pgpep1Q9ESW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pgpep1Q9ESW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pgpep1Q9ESW8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pgpep1Q9ESW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pgpep1Q9ESW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pgpep1Q9ESW8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pgpep1Q9ESW8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pgpep1Q9ESW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pgpep1Q9ESW8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pgpep1Q9ESW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pgpep1Q9ESW8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pgpep1Q9ESW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pgpep1Q9ESW8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pgpep1Q9ESW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pgpep1Q9ESW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pgpep1Q9ESW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pgpep1Q9ESW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pgpep1Q9ESW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pgpep1Q9ESW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pgpep1Q9ESW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pgpep1Q9ESW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pgpep1Q9ESW8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pgpep1Q9ESW8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pgpep1Q9ESW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pgpep1Q9ESW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pgpep1Q9ESW8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pgpep1Q9ESW8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pgpep1Q9ESW8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pgpep1Q9ESW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pgpep1Q9ESW8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pgpep1Q9ESW8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pgpep1Q9ESW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pgpep1Q9ESW8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pgpep1Q9ESW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pgpep1Q9ESW8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pgpep1Q9ESW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pgpep1Q9ESW8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pgpep1Q9ESW8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pgpep1Q9ESW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pgpep1Q9ESW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pgpep1Q9ESW8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pgpep1Q9ESW8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pgpep1Q9ESW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pgpep1Q9ESW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pgpep1Q9ESW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pgpep1Q9ESW8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pgpep1Q9ESW8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pgpep1Q9ESW8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pgpep1Q9ESW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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