Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWK4

Cd5l, CD5 antigen-like, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5lQ9QWK4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cd5lQ9QWK4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd5lQ9QWK4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd5lQ9QWK4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd5lQ9QWK4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cd5lQ9QWK4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd5lQ9QWK4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cd5lQ9QWK4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd5lQ9QWK4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd5lQ9QWK4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd5lQ9QWK4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd5lQ9QWK4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cd5lQ9QWK4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd5lQ9QWK4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd5lQ9QWK4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd5lQ9QWK4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd5lQ9QWK4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd5lQ9QWK4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cd5lQ9QWK4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cd5lQ9QWK4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cd5lQ9QWK4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd5lQ9QWK4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd5lQ9QWK4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd5lQ9QWK4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd5lQ9QWK4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd5lQ9QWK4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd5lQ9QWK4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd5lQ9QWK4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd5lQ9QWK4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd5lQ9QWK4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd5lQ9QWK4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd5lQ9QWK4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd5lQ9QWK4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd5lQ9QWK4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd5lQ9QWK4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd5lQ9QWK4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd5lQ9QWK4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd5lQ9QWK4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd5lQ9QWK4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd5lQ9QWK4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd5lQ9QWK4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd5lQ9QWK4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd5lQ9QWK4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd5lQ9QWK4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd5lQ9QWK4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd5lQ9QWK4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd5lQ9QWK4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd5lQ9QWK4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd5lQ9QWK4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd5lQ9QWK4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd5lQ9QWK4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd5lQ9QWK4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd5lQ9QWK4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd5lQ9QWK4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd5lQ9QWK4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd5lQ9QWK4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd5lQ9QWK4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd5lQ9QWK4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd5lQ9QWK4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd5lQ9QWK4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd5lQ9QWK4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd5lQ9QWK4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd5lQ9QWK4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd5lQ9QWK4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd5lQ9QWK4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd5lQ9QWK4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd5lQ9QWK4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd5lQ9QWK4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd5lQ9QWK4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd5lQ9QWK4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd5lQ9QWK4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd5lQ9QWK4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd5lQ9QWK4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd5lQ9QWK4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd5lQ9QWK4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd5lQ9QWK4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd5lQ9QWK4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd5lQ9QWK4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd5lQ9QWK4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd5lQ9QWK4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd5lQ9QWK4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd5lQ9QWK4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd5lQ9QWK4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd5lQ9QWK4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd5lQ9QWK4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd5lQ9QWK4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd5lQ9QWK4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd5lQ9QWK4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd5lQ9QWK4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd5lQ9QWK4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd5lQ9QWK4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd5lQ9QWK4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd5lQ9QWK4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd5lQ9QWK4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd5lQ9QWK4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd5lQ9QWK4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd5lQ9QWK4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd5lQ9QWK4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd5lQ9QWK4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd5lQ9QWK4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms