Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LoxP28301 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LoxP28301 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LoxP28301 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LoxP28301 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LoxP28301 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LoxP28301 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LoxP28301 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LoxP28301 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LoxP28301 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LoxP28301 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LoxP28301 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LoxP28301 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LoxP28301 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LoxP28301 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LoxP28301 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LoxP28301 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LoxP28301 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LoxP28301 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LoxP28301 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LoxP28301 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LoxP28301 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LoxP28301 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LoxP28301 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LoxP28301 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LoxP28301 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LoxP28301 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LoxP28301 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LoxP28301 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LoxP28301 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LoxP28301 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LoxP28301 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LoxP28301 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LoxP28301 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LoxP28301 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LoxP28301 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LoxP28301 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LoxP28301 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LoxP28301 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LoxP28301 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LoxP28301 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LoxP28301 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LoxP28301 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LoxP28301 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LoxP28301 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LoxP28301 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LoxP28301 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LoxP28301 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LoxP28301 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LoxP28301 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LoxP28301 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LoxP28301 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LoxP28301 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LoxP28301 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LoxP28301 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LoxP28301 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LoxP28301 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LoxP28301 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LoxP28301 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LoxP28301 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LoxP28301 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LoxP28301 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LoxP28301 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LoxP28301 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LoxP28301 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LoxP28301 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LoxP28301 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LoxP28301 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LoxP28301 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LoxP28301 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LoxP28301 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LoxP28301 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LoxP28301 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LoxP28301 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LoxP28301 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LoxP28301 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LoxP28301 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LoxP28301 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LoxP28301 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LoxP28301 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LoxP28301 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LoxP28301 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LoxP28301 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LoxP28301 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LoxP28301 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LoxP28301 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LoxP28301 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LoxP28301 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LoxP28301 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LoxP28301 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LoxP28301 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LoxP28301 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LoxP28301 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LoxP28301 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LoxP28301 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LoxP28301 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LoxP28301 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LoxP28301 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LoxP28301 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LoxP28301 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms