Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU9

Crybb3, Beta-crystallin B3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crybb3Q9JJU9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Crybb3Q9JJU9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Crybb3Q9JJU9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Crybb3Q9JJU9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Crybb3Q9JJU9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Crybb3Q9JJU9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Crybb3Q9JJU9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Crybb3Q9JJU9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Crybb3Q9JJU9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Crybb3Q9JJU9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Crybb3Q9JJU9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Crybb3Q9JJU9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Crybb3Q9JJU9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Crybb3Q9JJU9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Crybb3Q9JJU9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Crybb3Q9JJU9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Crybb3Q9JJU9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Crybb3Q9JJU9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Crybb3Q9JJU9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Crybb3Q9JJU9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Crybb3Q9JJU9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Crybb3Q9JJU9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Crybb3Q9JJU9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Crybb3Q9JJU9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Crybb3Q9JJU9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Crybb3Q9JJU9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Crybb3Q9JJU9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Crybb3Q9JJU9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Crybb3Q9JJU9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Crybb3Q9JJU9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Crybb3Q9JJU9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Crybb3Q9JJU9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Crybb3Q9JJU9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Crybb3Q9JJU9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Crybb3Q9JJU9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Crybb3Q9JJU9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Crybb3Q9JJU9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Crybb3Q9JJU9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Crybb3Q9JJU9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Crybb3Q9JJU9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Crybb3Q9JJU9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
Crybb3Q9JJU9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Crybb3Q9JJU9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Crybb3Q9JJU9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Crybb3Q9JJU9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,97■■□□□ 1,27
Crybb3Q9JJU9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Crybb3Q9JJU9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Crybb3Q9JJU9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Crybb3Q9JJU9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Crybb3Q9JJU9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Crybb3Q9JJU9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Crybb3Q9JJU9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Crybb3Q9JJU9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Crybb3Q9JJU9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Crybb3Q9JJU9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Crybb3Q9JJU9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,46■■□□□ 1,19
Crybb3Q9JJU9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Crybb3Q9JJU9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Crybb3Q9JJU9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Crybb3Q9JJU9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Crybb3Q9JJU9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Crybb3Q9JJU9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Crybb3Q9JJU9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Crybb3Q9JJU9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
Crybb3Q9JJU9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Crybb3Q9JJU9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Crybb3Q9JJU9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,24■■□□□ 1,15
Crybb3Q9JJU9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Crybb3Q9JJU9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
Crybb3Q9JJU9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Crybb3Q9JJU9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Crybb3Q9JJU9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Crybb3Q9JJU9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Crybb3Q9JJU9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Crybb3Q9JJU9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Crybb3Q9JJU9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Crybb3Q9JJU9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Crybb3Q9JJU9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Crybb3Q9JJU9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Crybb3Q9JJU9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Crybb3Q9JJU9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Crybb3Q9JJU9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Crybb3Q9JJU9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Crybb3Q9JJU9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Crybb3Q9JJU9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Crybb3Q9JJU9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Crybb3Q9JJU9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Crybb3Q9JJU9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Crybb3Q9JJU9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Crybb3Q9JJU9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Crybb3Q9JJU9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Crybb3Q9JJU9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Crybb3Q9JJU9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Crybb3Q9JJU9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Crybb3Q9JJU9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Crybb3Q9JJU9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Crybb3Q9JJU9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Crybb3Q9JJU9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Crybb3Q9JJU9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Crybb3Q9JJU9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
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