Protein–RNA interactions for Protein: P63271

Supt4h1a, Transcription elongation factor SPT4-A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1aP63271 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt4h1aP63271 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt4h1aP63271 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt4h1aP63271 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt4h1aP63271 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt4h1aP63271 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Supt4h1aP63271 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt4h1aP63271 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Supt4h1aP63271 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Supt4h1aP63271 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt4h1aP63271 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt4h1aP63271 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt4h1aP63271 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Supt4h1aP63271 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Supt4h1aP63271 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt4h1aP63271 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt4h1aP63271 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt4h1aP63271 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt4h1aP63271 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt4h1aP63271 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt4h1aP63271 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt4h1aP63271 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt4h1aP63271 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Supt4h1aP63271 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt4h1aP63271 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Supt4h1aP63271 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Supt4h1aP63271 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Supt4h1aP63271 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt4h1aP63271 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt4h1aP63271 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt4h1aP63271 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Supt4h1aP63271 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Supt4h1aP63271 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt4h1aP63271 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt4h1aP63271 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Supt4h1aP63271 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Supt4h1aP63271 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt4h1aP63271 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt4h1aP63271 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt4h1aP63271 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt4h1aP63271 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt4h1aP63271 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt4h1aP63271 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt4h1aP63271 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Supt4h1aP63271 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Supt4h1aP63271 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt4h1aP63271 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt4h1aP63271 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt4h1aP63271 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt4h1aP63271 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt4h1aP63271 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Supt4h1aP63271 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Supt4h1aP63271 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Supt4h1aP63271 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Supt4h1aP63271 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt4h1aP63271 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt4h1aP63271 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt4h1aP63271 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt4h1aP63271 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt4h1aP63271 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt4h1aP63271 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Supt4h1aP63271 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Supt4h1aP63271 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt4h1aP63271 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt4h1aP63271 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt4h1aP63271 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt4h1aP63271 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt4h1aP63271 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Supt4h1aP63271 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Supt4h1aP63271 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Supt4h1aP63271 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt4h1aP63271 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt4h1aP63271 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt4h1aP63271 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt4h1aP63271 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt4h1aP63271 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt4h1aP63271 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt4h1aP63271 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Supt4h1aP63271 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Supt4h1aP63271 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Supt4h1aP63271 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Supt4h1aP63271 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt4h1aP63271 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt4h1aP63271 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt4h1aP63271 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Supt4h1aP63271 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Supt4h1aP63271 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Supt4h1aP63271 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Supt4h1aP63271 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt4h1aP63271 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt4h1aP63271 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt4h1aP63271 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt4h1aP63271 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Supt4h1aP63271 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt4h1aP63271 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Supt4h1aP63271 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt4h1aP63271 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt4h1aP63271 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt4h1aP63271 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt4h1aP63271 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms