Protein–RNA interactions for Protein: P63271

Supt4h1a, Transcription elongation factor SPT4-A, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1aP63271 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Supt4h1aP63271 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Supt4h1aP63271 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Supt4h1aP63271 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Supt4h1aP63271 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Supt4h1aP63271 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Supt4h1aP63271 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Supt4h1aP63271 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Supt4h1aP63271 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Supt4h1aP63271 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Supt4h1aP63271 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Supt4h1aP63271 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Supt4h1aP63271 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Supt4h1aP63271 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Supt4h1aP63271 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Supt4h1aP63271 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Supt4h1aP63271 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Supt4h1aP63271 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Supt4h1aP63271 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Supt4h1aP63271 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Supt4h1aP63271 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Supt4h1aP63271 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Supt4h1aP63271 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Supt4h1aP63271 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Supt4h1aP63271 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Supt4h1aP63271 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Supt4h1aP63271 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Supt4h1aP63271 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Supt4h1aP63271 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Supt4h1aP63271 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Supt4h1aP63271 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Supt4h1aP63271 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Supt4h1aP63271 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Supt4h1aP63271 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Supt4h1aP63271 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Supt4h1aP63271 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Supt4h1aP63271 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Supt4h1aP63271 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Supt4h1aP63271 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Supt4h1aP63271 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,5■■□□□ 1,51
Supt4h1aP63271 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Supt4h1aP63271 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Supt4h1aP63271 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Supt4h1aP63271 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Supt4h1aP63271 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Supt4h1aP63271 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Supt4h1aP63271 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Supt4h1aP63271 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Supt4h1aP63271 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Supt4h1aP63271 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Supt4h1aP63271 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Supt4h1aP63271 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Supt4h1aP63271 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Supt4h1aP63271 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Supt4h1aP63271 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Supt4h1aP63271 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Supt4h1aP63271 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Supt4h1aP63271 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Supt4h1aP63271 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Supt4h1aP63271 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Supt4h1aP63271 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Supt4h1aP63271 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Supt4h1aP63271 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
Supt4h1aP63271 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Supt4h1aP63271 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Supt4h1aP63271 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Supt4h1aP63271 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Supt4h1aP63271 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Supt4h1aP63271 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Supt4h1aP63271 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Supt4h1aP63271 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Supt4h1aP63271 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Supt4h1aP63271 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
Supt4h1aP63271 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Supt4h1aP63271 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Supt4h1aP63271 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Supt4h1aP63271 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Supt4h1aP63271 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Supt4h1aP63271 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Supt4h1aP63271 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Supt4h1aP63271 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Supt4h1aP63271 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
Supt4h1aP63271 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Supt4h1aP63271 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Supt4h1aP63271 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Supt4h1aP63271 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Supt4h1aP63271 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Supt4h1aP63271 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Supt4h1aP63271 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Supt4h1aP63271 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Supt4h1aP63271 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Supt4h1aP63271 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Supt4h1aP63271 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Supt4h1aP63271 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Supt4h1aP63271 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Supt4h1aP63271 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Supt4h1aP63271 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Supt4h1aP63271 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Supt4h1aP63271 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Supt4h1aP63271 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
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