Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S5

Klf11, Krueppel-like factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf11Q8K1S5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Klf11Q8K1S5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Klf11Q8K1S5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Klf11Q8K1S5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Klf11Q8K1S5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Klf11Q8K1S5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Klf11Q8K1S5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Klf11Q8K1S5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Klf11Q8K1S5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klf11Q8K1S5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Klf11Q8K1S5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Klf11Q8K1S5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Klf11Q8K1S5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klf11Q8K1S5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klf11Q8K1S5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Klf11Q8K1S5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klf11Q8K1S5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Klf11Q8K1S5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Klf11Q8K1S5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klf11Q8K1S5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Klf11Q8K1S5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klf11Q8K1S5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klf11Q8K1S5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Klf11Q8K1S5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Klf11Q8K1S5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klf11Q8K1S5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klf11Q8K1S5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Klf11Q8K1S5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Klf11Q8K1S5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klf11Q8K1S5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Klf11Q8K1S5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klf11Q8K1S5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Klf11Q8K1S5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klf11Q8K1S5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Klf11Q8K1S5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klf11Q8K1S5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Klf11Q8K1S5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klf11Q8K1S5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Klf11Q8K1S5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Klf11Q8K1S5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Klf11Q8K1S5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Klf11Q8K1S5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klf11Q8K1S5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klf11Q8K1S5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klf11Q8K1S5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klf11Q8K1S5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klf11Q8K1S5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klf11Q8K1S5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klf11Q8K1S5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klf11Q8K1S5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klf11Q8K1S5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klf11Q8K1S5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klf11Q8K1S5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klf11Q8K1S5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klf11Q8K1S5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klf11Q8K1S5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klf11Q8K1S5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klf11Q8K1S5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Klf11Q8K1S5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Klf11Q8K1S5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klf11Q8K1S5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klf11Q8K1S5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klf11Q8K1S5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klf11Q8K1S5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klf11Q8K1S5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klf11Q8K1S5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klf11Q8K1S5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klf11Q8K1S5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klf11Q8K1S5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klf11Q8K1S5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klf11Q8K1S5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klf11Q8K1S5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klf11Q8K1S5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klf11Q8K1S5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Klf11Q8K1S5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klf11Q8K1S5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klf11Q8K1S5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Klf11Q8K1S5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klf11Q8K1S5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klf11Q8K1S5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klf11Q8K1S5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klf11Q8K1S5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klf11Q8K1S5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klf11Q8K1S5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klf11Q8K1S5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Klf11Q8K1S5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Klf11Q8K1S5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klf11Q8K1S5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Klf11Q8K1S5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klf11Q8K1S5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klf11Q8K1S5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klf11Q8K1S5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klf11Q8K1S5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klf11Q8K1S5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klf11Q8K1S5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klf11Q8K1S5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klf11Q8K1S5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Klf11Q8K1S5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klf11Q8K1S5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Klf11Q8K1S5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms