RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP43P25359 394 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M GEX1P25596 615 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MSP1P28737 362 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MEI4P29467 408 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM26P32858 118 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M LIP5P32875 414 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TGL4P36165 910 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M GEX2P36173 615 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YBP1P38315 674 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR238CP38330 731 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TAE1P38340 232 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M WSC4P38739 605 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PFS1P38872 237 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SMC2P38989 1170 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M LYS9P38999 446 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M VAC8P39968 578 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL028WP39989 153 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M VFA1P40080 203 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT8P40886 569 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RRT5P43607 289 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M DUG1P43616 481 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SNG1P46950 547 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CIS3P47001 227 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CSN12P47130 423 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M COQ5P49017 307 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL140CP53120 1219 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PUS2P53167 370 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR111WP53265 400 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SUN4P53616 420 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M JJJ1P53863 590 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC55Q00362 526 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SND1Q04007 877 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SWC7Q06707 132 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TFB4Q12004 338 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M GNT1Q12096 491 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SEY1Q99287 776 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM44Q99299 758 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M Q0182Q9ZZW1 134 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M IRA2P19158 3079 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M LAA1P39526 2014 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TOR1P35169 2470 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS3P05750 240 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ADE3P07245 946 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SFL1P20134 766 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL8P22353 238 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RBK1P25332 333 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MCM2P29469 868 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PYC2P32327 1180 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M KAR9P32526 644 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ABD1P32783 436 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TFA2P36145 328 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ARL1P38116 183 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SWC5P38326 303 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M BIT2P38346 545 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SLX8P40072 274 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD26P40352 1085 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL070CP40361 888 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ATM1P40416 690 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ASG1P40467 964 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M DSN1P40568 576 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TFG2P41896 400 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SUM1P46676 1062 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS10BP46784 105 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M GLG2P47011 380 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ALY2P47029 1046 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR124CP47159 448 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP84P52891 726 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MNT2P53059 558 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX31P53203 462 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M NOG2P53742 486 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SWS2P53937 143 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR187CQ03236 431 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M INP2Q03824 705 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MSH6Q03834 1242 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SXM1Q04175 944 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR278CQ05612 105 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR456WQ06199 204 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR001CQ07895 862 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M RKM5Q12367 367 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL077CQ3E7X8 1277 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M COX5AP00424 153 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MPH2P0CD99 609 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M EST1P17214 699 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TEC1P18412 486 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PMA2P19657 947 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CHL1P22516 861 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MNE1P24720 663 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.2 ms