RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP43P25359 394 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K GEX1P25596 615 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MSP1P28737 362 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MEI4P29467 408 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM26P32858 118 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K LIP5P32875 414 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TGL4P36165 910 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K GEX2P36173 615 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YBP1P38315 674 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR238CP38330 731 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TAE1P38340 232 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K WSC4P38739 605 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PFS1P38872 237 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SMC2P38989 1170 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K LYS9P38999 446 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K VAC8P39968 578 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL028WP39989 153 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K VFA1P40080 203 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K HXT8P40886 569 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RRT5P43607 289 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K DUG1P43616 481 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SNG1P46950 547 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CIS3P47001 227 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CSN12P47130 423 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K COQ5P49017 307 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL140CP53120 1219 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PUS2P53167 370 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR111WP53265 400 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SUN4P53616 420 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K JJJ1P53863 590 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC55Q00362 526 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SND1Q04007 877 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SWC7Q06707 132 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TFB4Q12004 338 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K GNT1Q12096 491 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SEY1Q99287 776 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM44Q99299 758 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K Q0182Q9ZZW1 134 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K IRA2P19158 3079 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K LAA1P39526 2014 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TOR1P35169 2470 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS3P05750 240 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ADE3P07245 946 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SFL1P20134 766 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL8P22353 238 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RBK1P25332 333 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MCM2P29469 868 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PYC2P32327 1180 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K KAR9P32526 644 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ABD1P32783 436 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TFA2P36145 328 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ARL1P38116 183 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SWC5P38326 303 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K BIT2P38346 545 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SLX8P40072 274 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD26P40352 1085 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL070CP40361 888 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ATM1P40416 690 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ASG1P40467 964 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K DSN1P40568 576 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TFG2P41896 400 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SUM1P46676 1062 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS10BP46784 105 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K GLG2P47011 380 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ALY2P47029 1046 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR124CP47159 448 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K NUP84P52891 726 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MNT2P53059 558 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX31P53203 462 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K NOG2P53742 486 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SWS2P53937 143 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR187CQ03236 431 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K INP2Q03824 705 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MSH6Q03834 1242 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SXM1Q04175 944 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR278CQ05612 105 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR456WQ06199 204 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR001CQ07895 862 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K RKM5Q12367 367 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL077CQ3E7X8 1277 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K COX5AP00424 153 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MPH2P0CD99 609 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K EST1P17214 699 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TEC1P18412 486 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PMA2P19657 947 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CHL1P22516 861 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MNE1P24720 663 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
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