RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 BCANQ96GW7 911 aa31.14■■■□□ 2.58
ELL3-201ENST00000319359 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.13■■■□□ 2.57
ELL3-201ENST00000319359 WDR97A6NE52 1622 aa31.12■■■□□ 2.57
ELL3-201ENST00000319359 P3H3Q8IVL6 736 aa31.12■■■□□ 2.57
ELL3-201ENST00000319359 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
ELL3-201ENST00000319359 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.09■■■□□ 2.57
ELL3-201ENST00000319359 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
ELL3-201ENST00000319359 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.06■■■□□ 2.56
ELL3-201ENST00000319359 MAP3K1Q13233 1512 aa30.98■■■□□ 2.55
ELL3-201ENST00000319359 FKBP8Q14318 412 aa30.97■■■□□ 2.55
ELL3-201ENST00000319359 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
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ELL3-201ENST00000319359 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.86■■■□□ 2.53
ELL3-201ENST00000319359 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.83■■■□□ 2.53
ELL3-201ENST00000319359 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.82■■■□□ 2.52
ELL3-201ENST00000319359 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.82■■■□□ 2.52
ELL3-201ENST00000319359 PRDM2Q13029 1718 aa30.81■■■□□ 2.52
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ELL3-201ENST00000319359 ANP32CO43423 234 aa30.71■■■□□ 2.51
ELL3-201ENST00000319359 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.7■■■□□ 2.5
ELL3-201ENST00000319359 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.69■■■□□ 2.5
ELL3-201ENST00000319359 CCER2I3L3R5 266 aa30.64■■■□□ 2.5
ELL3-201ENST00000319359 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.63■■■□□ 2.49
ELL3-201ENST00000319359 NEFLP07196 543 aa30.62■■■□□ 2.49
ELL3-201ENST00000319359 TONSLQ96HA7 1378 aa30.61■■■□□ 2.49
ELL3-201ENST00000319359 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.61■■■□□ 2.49
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ELL3-201ENST00000319359 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.59■■■□□ 2.49
ELL3-201ENST00000319359 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.57■■■□□ 2.48
ELL3-201ENST00000319359 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.56■■■□□ 2.48
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ELL3-201ENST00000319359 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.48
ELL3-201ENST00000319359 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.49■■■□□ 2.47
ELL3-201ENST00000319359 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
ELL3-201ENST00000319359 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.48■■■□□ 2.47
ELL3-201ENST00000319359 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
ELL3-201ENST00000319359 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.46■■■□□ 2.47
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ELL3-201ENST00000319359 HFM1A2PYH4 1435 aa30.45■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 UACAQ9BZF9 1416 aa30.45■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.43■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 TOPBP1Q92547 1522 aa30.41■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 NAIPQ13075 1403 aa30.41■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 FMN1Q68DA7 1419 aa30.41■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.4■■■□□ 2.46
ELL3-201ENST00000319359 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.45
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ELL3-201ENST00000319359 NESP48681 1621 aa30.38■■■□□ 2.45
ELL3-201ENST00000319359 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.37■■■□□ 2.45
ELL3-201ENST00000319359 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.35■■■□□ 2.45
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ELL3-201ENST00000319359 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.34■■■□□ 2.45
ELL3-201ENST00000319359 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.33■■■□□ 2.45
ELL3-201ENST00000319359 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.32■■■□□ 2.44
ELL3-201ENST00000319359 CUL7Q14999 1698 aa30.31■■■□□ 2.44
ELL3-201ENST00000319359 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.3■■■□□ 2.44
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ELL3-201ENST00000319359 CCDC184Q52MB2 194 aa30.25■■■□□ 2.43
ELL3-201ENST00000319359 GRIN2BQ13224 1484 aa30.23■■■□□ 2.43
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ELL3-201ENST00000319359 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.18■■■□□ 2.42
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ELL3-201ENST00000319359 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ELL3-201ENST00000319359 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
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ELL3-201ENST00000319359 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.11■■■□□ 2.41
ELL3-201ENST00000319359 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.11■■■□□ 2.41
ELL3-201ENST00000319359 BCL11AQ9H165 835 aa30.1■■■□□ 2.41
ELL3-201ENST00000319359 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.09■■■□□ 2.41
ELL3-201ENST00000319359 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.07■■■□□ 2.4
ELL3-201ENST00000319359 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.06■■■□□ 2.4
ELL3-201ENST00000319359 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.05■■■□□ 2.4
ELL3-201ENST00000319359 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.05■■■□□ 2.4
ELL3-201ENST00000319359 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
ELL3-201ENST00000319359 ARHGEF11O15085 1522 aa30.05■■■□□ 2.4
ELL3-201ENST00000319359 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.03■■■□□ 2.4
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ELL3-201ENST00000319359 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
ELL3-201ENST00000319359 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.97■■■□□ 2.39
ELL3-201ENST00000319359 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.96■■■□□ 2.39
ELL3-201ENST00000319359 CCDC7Q96M83 1385 aa29.95■■■□□ 2.38
ELL3-201ENST00000319359 MRS2Q9HD23 443 aa29.94■■■□□ 2.38
ELL3-201ENST00000319359 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
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ELL3-201ENST00000319359 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.93■■■□□ 2.38
ELL3-201ENST00000319359 NCOA1Q15788 1441 aa29.91■■■□□ 2.38
ELL3-201ENST00000319359 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.91■■■□□ 2.38
ELL3-201ENST00000319359 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.9■■■□□ 2.38
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