RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M OPT2Q06593 877 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR078CQ06813 372 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AAD4Q07747 329 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR012CQ07927 99 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM39Q08223 395 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M APC5Q08683 685 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PER33Q12144 273 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.73□□□□□ -1.97not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M BI3Q9ZZW7 517 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HIS1P00498 297 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M LEU1P07264 779 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SST2P11972 698 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC63P14906 663 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CYC8P14922 966 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ATE1P16639 503 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M DAL81P21657 970 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT5P27692 1063 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M PMI40P29952 429 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SPC110P32380 944 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT3P32466 567 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN12P32496 274 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL050CP35736 922 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M DCW1P36091 449 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M NCL1P38205 684 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M OCA5P38738 679 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR078WP38799 552 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M LAM1P38851 1228 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M EXO1P39875 702 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M STL1P39932 569 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M KTR7P40504 517 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL054WP40524 105 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM23P47015 356 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M COG7P53195 279 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC1P53236 928 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SNO2P53823 222 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ESBP6P53918 673 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YAT1P80235 687 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HAP5Q02516 242 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M UFO1Q04511 668 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M HPF1Q05164 967 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M LCB5Q06147 687 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M YFT2Q06676 274 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG10Q07879 167 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M OPI10Q08202 246 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP6Q12149 733 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO21Q12411 609 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS5Q92331 675 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP27Q06179 2628 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)MtW(CCA)M COX3P00420 269 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RED1P14291 827 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PUT4P15380 627 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO12P17123 173 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CLC1P17891 233 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SLX5P32828 619 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PXA2P34230 853 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ADD66P36040 267 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PXL1P36166 706 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL40P36534 297 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SRP68P38687 599 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TDA3P38758 523 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M CRP1P38845 465 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M FAA3P39002 694 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM9P39551 298 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TMN3P40071 706 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M KHA1P40309 873 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PAN6P40459 309 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data2.71□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M NBP35P52920 328 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM14P53109 570 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR127WP53275 312 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM13P53299 105 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M VAC7P53950 1165 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PIR1Q03178 341 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR444WQ04093 687 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM32Q04689 311 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR222WQ04925 415 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M THI21Q08975 551 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG9Q12142 997 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR046CQ12253 270 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX11Q12462 236 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M NAG1Q8TGN9 163 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M AFI1Q99222 893 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M ENO1P00924 437 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M PYC1P11154 1178 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM1P15565 570 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)MtW(CCA)M MIH1P23748 554 aa2.7□□□□□ -1.98
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