RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G2

tW(CCA)G2, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G2, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 OPT2Q06593 877 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YPR078CQ06813 372 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AAD4Q07747 329 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YLR012CQ07927 99 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM39Q08223 395 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 APC5Q08683 685 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PER33Q12144 273 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.73□□□□□ -1.97not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BI3Q9ZZW7 517 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HIS1P00498 297 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LEU1P07264 779 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SST2P11972 698 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SEC63P14906 663 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CYC8P14922 966 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATE1P16639 503 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DAL81P21657 970 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPT5P27692 1063 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PMI40P29952 429 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPC110P32380 944 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HXT3P32466 567 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPN12P32496 274 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YKL050CP35736 922 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 DCW1P36091 449 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NCL1P38205 684 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 OCA5P38738 679 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YHR078WP38799 552 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LAM1P38851 1228 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 EXO1P39875 702 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 STL1P39932 569 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 KTR7P40504 517 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YIL054WP40524 105 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM23P47015 356 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 COG7P53195 279 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RSC1P53236 928 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SNO2P53823 222 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ESBP6P53918 673 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YAT1P80235 687 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HAP5Q02516 242 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UFO1Q04511 668 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HPF1Q05164 967 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LCB5Q06147 687 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YFT2Q06676 274 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATG10Q07879 167 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 OPI10Q08202 246 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RRP6Q12149 733 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPO21Q12411 609 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VPS5Q92331 675 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FMP27Q06179 2628 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 COX3P00420 269 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RED1P14291 827 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PUT4P15380 627 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPO12P17123 173 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CLC1P17891 233 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SLX5P32828 619 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PXA2P34230 853 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ADD66P36040 267 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PXL1P36166 706 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MRPL40P36534 297 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SRP68P38687 599 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TDA3P38758 523 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CRP1P38845 465 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FAA3P39002 694 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PRM9P39551 298 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TMN3P40071 706 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 KHA1P40309 873 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PAN6P40459 309 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data2.71□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NBP35P52920 328 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM14P53109 570 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YGR127WP53275 312 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TIM13P53299 105 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VAC7P53950 1165 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PIR1Q03178 341 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YDR444WQ04093 687 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AIM32Q04689 311 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YDR222WQ04925 415 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 THI21Q08975 551 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ATG9Q12142 997 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YLR046CQ12253 270 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PEX11Q12462 236 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NAG1Q8TGN9 163 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 AFI1Q99222 893 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ENO1P00924 437 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PYC1P11154 1178 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TRM1P15565 570 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MIH1P23748 554 aa2.7□□□□□ -1.98
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