RNA–Protein interactions for RNA: YOL053W

AIM39, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene AIM39, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM39	YOL053W	RFX1	P48743	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM39	YOL053W	IRC13	Q08630	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM39	YOL053W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AIM39	YOL053W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AIM39	YOL053W	TRM13	Q12383	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM39	YOL053W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	PCK1	P10963	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	SEC12	P11655	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	CHS3	P29465	1165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
AIM39	YOL053W	MNT3	P40549	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	TIM50	Q02776	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	RRI2	Q12348	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	VPS33	P20795	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	RIT1	P23796	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ERG4	P25340	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	RNQ1	P25367	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	MRPL36	P36531	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YBR138C	P38277	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
AIM39	YOL053W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	VFA1	P40080	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	LRO1	P40345	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	POL31	P46957	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YJL163C	P46996	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	BNA1	P47096	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	MEP3	P53390	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ARA2	Q04212	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ENT2	Q05785	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ADY4	Q05955	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ARR3	Q06598	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	FRE5	Q08908	694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	SIR3	P06701	978 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	NTH1	P32356	751 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	SLC1	P33333	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	NPR3	P38742	1146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YJL193W	P39542	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	CAB2	P40506	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	MPS3	P47069	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	IMA1	P53051	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	PHO11	P35842	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	PHO12	P38693	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	FMP52	P40008	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	KHA1	P40309	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	PHO23	P50947	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	TRS31	Q03337	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	VPS64	Q03944	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	VID22	Q05934	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	AIM39	Q08223	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	CTT1	P06115	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ALG7	P07286	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	BIK1	P11709	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	CTP1	P38152	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	IFA38	P38286	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	STB5	P38699	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	UME6	P39001	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	TMA108	P40462	946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	CTF18	P49956	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	SAP4	P53036	818 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	FHN1	P53279	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	RNT1	Q02555	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ATG21	Q02887	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	TFC6	Q06339	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	IZH3	Q07959	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	TRM8	Q12009	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	MLH3	Q12083	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
AIM39	YOL053W	BET2	P20133	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	HCM1	P25364	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	DSS4	P32601	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ELM1	P32801	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	SET3	P36124	751 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	AVT1	P47082	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	COS12	P53053	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	YAP1802	P53309	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIM39	YOL053W	ICL2	Q12031	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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